10x 學習中心
新手指南讓您信心滿滿地開展單細胞RNA-seq
為了追求更好的科學研究，您需要更好的數據，而單細胞方法提供了其他方法無法比擬的高分辨率見解。我們的學習中心介紹了這一變革性的研究工具，讓更多研究人員能夠開展更具影響力的研究。
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新手指南讓您信心滿滿地開展單細胞RNA-seq
為了追求更好的科學研究，您需要更好的數據，而單細胞方法提供了其他方法無法比擬的高分辨率見解。我們的學習中心介紹了這一變革性的研究工具，讓更多研究人員能夠開展更具影響力的研究。
什么是單細胞RNA測序？
單細胞RNA測序（scRNA-seq）技術測定單個細胞的全轉錄組基因表達，有助于詳細了解細胞在復雜組織中如何發揮功能和相互作用。通過追蹤單個轉錄本的來源細胞，研究人員能夠在高度異質的樣本中找出獨特的基因表達譜，最終揭示出其他方法經常遺漏的稀有細胞類型和動態細胞狀態。例如，研究人員在利用批量細胞RNA-seq（測定大量細胞的基因表達平均值）分析一種致命的腫瘤時，可能會漏掉一小部分對治療耐藥的細胞，從而忽略了潛在的藥物靶點。
單細胞分析能夠為我的研究做些什么？
10x Genomics是單細胞研究領域公認的引領者，通過優化的方案、端對端的支持和易用的分析工具擴大了單細胞分析的范圍。以10年經驗、2200多項專利和超過15億美元的研發投資作為后盾，我們的技術幫助研究人員發表了8000多篇研究論文，其中許多應用實例展示了我們工具的高影響力。
繪制健康和病變組織的全面單細胞多組學圖譜，以鑒定疾病特異性的細胞或細胞狀態。
捕捉樣本中數千個至數百萬個細胞的完整異質性。
追蹤細胞狀態隨時間的變化，以描繪發育通路、疾病進展和免疫反應。
探索腫瘤微環境等生態位中淋巴細胞與目標細胞之間的相互作用。
高的細胞回收率，以及對稀有轉錄本和RNA含量較低細胞的靈敏檢測，讓您對數據充滿信心，而以往通過已知標志物很難捕捉或檢測這些轉錄本和細胞。
單細胞RNA-seq有哪些優勢？
| 單細胞RNA測序 | 批量細胞RNA測序 | 微陣列 | 流式細胞術 | IHC 或 IF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 好處 |
單細胞分辨率的全轉錄組分析，而不是平均化的群體數據 以高分辨率見解捕捉稀有細胞類型和動態細胞狀態 通過更高的靈敏度發現新的基因、細胞類型或稀有群體 |
樣本水平的全轉錄組分析，提供大量細胞的平均基因表達數據 因數據復雜度和分辨率較低，工作流程和數據分析更簡單 測序深度和成本較低，側重于群體水平的見解 |
定量感興趣的特定基因的表達水平 同時檢測數千個基因的表達情況 良好的驗證工具 對大規模研究而言具有成本效益 |
同時測定多個標記 每秒對數千個細胞進行高通量分析 每次實驗的成本很低 |
只需少量試劑即可完成的經濟操作 在組織背景下檢測基因表達 |
| 挑戰 |
人們普遍認為與批量分析相比成本較高 通常需要專業的分析 需要深度測序來捕捉稀有特征 |
群體平均值掩蓋了細胞異質性 低分辨率限制了對稀有或新細胞群的檢測 靈敏度低導致低水平轉錄本被遺漏 需要專門的軟件分析工具 |
群體平均結果掩蓋了細胞異質性 需要提前了解感興趣的基因 單次實驗成本高 靈敏度低，動態范圍小 |
僅限于預定義的細胞類別，由已知的 需要昂貴的專業設備，維護成本可能很高 復雜樣本的數據分析具有挑戰性 |
抗體的特異性可能發生變化（染色可能是非特異性的），通常需要抗體驗證 結果的定量可能具有挑戰性 作為多步驟程序中的一部分，需要昂貴的設備 |
單細胞分析如何在不增加復雜度或成本的情況下提升我的研究？
現在有了10x Genomics，單細胞研究比以往任何時候都更容易實現。我們的端對端平臺簡化了從樣本制備到數據分析的每一步，能夠快速經濟地提供高影響力的結果。作為可靠的引領者，我們確保無與倫比的數據質量，避免您錯過關鍵發現，從而保護您的樣本和預算。
1.常見的誤區：單細胞分析很昂貴
10x Genomics Chromium單細胞分析的真實情況
Chromium單細胞分析可以根據您的預算進行定制，且不會犧牲性能
對于新用戶而言，尤其是那些使用大量樣本的用戶，成本往往是主要障礙。但每個樣本的成本低并不一定意味著長遠的成本節約。如果沒有高分辨率，您可能會錯過一種新的細胞類型或一條低表達的轉錄本，而這些對您推進項目（或在高影響力期刊上發表文章）至關重要。
有了10x Genomics，您能夠獲得更好的數據，減少錯誤，并有信心在第一次就做好。
以每個樣本比此前更低的成本，您能夠獲得其他單細胞方法無法比擬的高分辨率結果，尤其是高達95%的可用讀數，讓您能夠以更低的測序成本檢測更多的基因。數據越多并不意味著越復雜——我們免費的分析流程無需任何生物信息學經驗。此外，由1,000多家核心實驗室組成的全球網絡讓您輕松上手，最大限度地減少您的投資和風險。
2.常見的誤區：單細胞分析只適用于新鮮樣本
10x Genomics Chromium單細胞分析的真實情況
Chromium單細胞分析能夠分析新鮮、冷凍和固定樣本，甚至是FFPE樣本
Chromium平臺能夠自信地應對各種研究問題，它附帶40多個示范方案，性能可靠，適用于新鮮、冷凍和固定樣本，甚至是FFPE樣本。
與Chromium單細胞分析兼容的樣本類型：
3.常見的誤區：單細胞工作流程復雜又耗時
10x Genomics Chromium單細胞分析的真實情況
我們久經考驗的工作流程很簡單，通過自動化最大限度減少了手動操作時間
每個實驗都可以分解為幾個關鍵步驟：樣本制備、運行檢測和數據分析——scRNA-seq也不例外。我們優化的方案、可靠的性能、儀器方面的支持以及直觀的分析流程讓任何用戶都能使用scRNA-seq，無論其經驗水平如何。
我們的自動化流程讓您充滿信息，提供卓越的可重復性并節省時間
我們將單細胞工作流程中最關鍵的步驟自動化，能在幾分鐘內生成數千個細胞的微滴，只需3-4小時的手動操作，最大限度減少手動操作中移液帶來的誤差。我們的工作流程特有簡約的按鈕式界面，可通過核心實驗室輕松訪問。
4.常見的誤區：單細胞數據很難分析——我必須聘請生物信息學家或與之合作
10x Genomics Chromium單細胞分析的真實情況
分析簡單直觀，無需專業知識
數據分析可能很困難，讓人不知所措，尤其是對不具備生物信息學經驗的人來說。我們開發出解決方案來簡化這一過程，利用我們用戶友好的分析工具和流程，研究人員可以更輕松地處理、可視化和探索他們的數據。
5.常見的誤區：采用這項技術需要大量的技術培訓及其他資源
10x Genomics Chromium單細胞分析的真實情況
我們全面的支持讓實驗入門變得簡單，為長久的成功提供保障
10x Genomics的技術專家在每一步都提供支持，從實驗規劃到數據分析。我們還提供由1,000多家核心實驗室組成的網絡，以及已發表8,000多篇論文的研究人員社群，為您提供額外的支持。您并不孤單——我們的內部專家、值得信賴的核心實驗室以及蓬勃發展的研究社群讓您擁有了成功所需的一切。
