隨著高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展,測序成本正以驚人的速度下降。據(jù)相關(guān)數(shù)據(jù)顯示,在過去的幾年時間,測序成本降低了數(shù)倍之多,這使得大規(guī)模測序項(xiàng)目變得更加可行,科研機(jī)構(gòu)和生物科技公司能夠以更低的成本獲取海量的遺傳信息。然而,在測序成本日益降低的同時,業(yè)界對文庫制備成本的要求也愈發(fā)嚴(yán)苛。在整個測序流程中,文庫制備作為關(guān)鍵的上游環(huán)節(jié),其成本控制直接影響著測序項(xiàng)目的整體經(jīng)濟(jì)效益。
如何在有效控制成本的同時確保數(shù)據(jù)質(zhì)量的高標(biāo)準(zhǔn),一直是科研人員面臨的關(guān)鍵問題。Twist 酶切片段化文庫制備試劑盒 (EF Local)的出現(xiàn),無疑為這一難題提供了全新的解決方案。
該試劑盒的目標(biāo)十分明確,旨在實(shí)現(xiàn)測序成本優(yōu)化與數(shù)據(jù)質(zhì)量保障的雙重目標(biāo)。在實(shí)際應(yīng)用場景中,無論是處理微量起始樣本,還是開展高通量項(xiàng)目,它都展現(xiàn)出了獨(dú)特的優(yōu)勢,能夠提供穩(wěn)定可靠的分析結(jié)果。
從核心優(yōu)勢來看,其成本效益顯著,作為經(jīng)濟(jì)型文庫制備方案,卻始終保持著出色的數(shù)據(jù)質(zhì)量。在品質(zhì)方面,低嵌合體率使其在各類樣本中都表現(xiàn)穩(wěn)定可靠,為實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性提供了堅實(shí)保障。高效流程也是一大亮點(diǎn),單管操作設(shè)計極大地簡化了實(shí)驗(yàn)步驟,有效提升了實(shí)驗(yàn)的時效性。
Twist 酶切片段化文庫制備試劑盒 (EF Local)工作流程
穩(wěn)定的DNA文庫片段大小
Twist 酶切片段化文庫制備試劑盒 (EF Local)在重復(fù)樣本間可生成一致的DNA文庫片段大小。下圖為使用該試劑盒生成的16個NGS文庫的電泳圖。
樣本間覆蓋均一
Twist 酶切片段化文庫制備試劑盒 (EF Local)在不同重復(fù)樣本間展現(xiàn)出均一的GC覆蓋表現(xiàn)。
降低嵌合體率,減少測序錯誤
在文庫制備過程中,盡可能避免不適當(dāng)?shù)腄NA連接或重組,能夠大幅減少嵌合體導(dǎo)致的測序錯誤。Twist 酶切片段化文庫制備試劑盒 (EF Local)在單樣本檢測和8樣本混檢中均展現(xiàn)出低嵌合體率。
性能穩(wěn)定可靠,結(jié)果值得信賴
Twist 酶切片段化文庫制備試劑盒 (EF Local)在降采樣至150×覆蓋深度時,30×深度下的中靶率超過90%,且Fold 80 penalty控制在1 .4 以下。