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        PCR不再是難題 Phusion實現更高更快更強[新品推薦]

        【字體: 時間:2011年02月01日 來源:生物通

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          今年初,賽默飛世爾科技將芬蘭Finnzymes公司收歸旗下。為啥?看中的就是它豐富的PCR產品線,包括DNA聚合酶、迷你PCR儀、新型PCR管和PCR板等等。也許您還不大了解,那么就讓生物通小編來帶你看看Finnzymes的明星產品。

        今年初,賽默飛世爾科技將芬蘭Finnzymes公司收歸旗下。為啥?看中的就是它豐富的PCR產品線,包括DNA聚合酶、迷你PCR儀、新型超薄壁PCR管和超薄壁PCR板等等。也許您還不大了解,那么就讓生物通小編來帶你看看Finnzymes的明星產品。

        Phusion® DNA聚合酶是Finnzymes的拳頭產品,它所提供的PCR性能是其它DNA聚合酶無法比擬的。它的主要特點可用四個詞概括:超保真、超快速、超強勁、超特異。

        這些是如何實現的呢?大家都知道,結構決定功能,那我們先來看看它的結構(下圖)。雙鏈DNA結合蛋白(紫色)與一種新型的具有校對功能的類熱球菌酶(綠色)融合,形成了一種獨特的高性能聚合酶——Phusion® DNA聚合酶。

        雙鏈DNA結合蛋白的存在提高了聚合酶對雙鏈DNA的親和力,使得每次酶與雙鏈發生結合反應時都能夠摻入更多的核苷酸,并減少了鏈延伸所需的結合反應次數。Phusion® DNA聚合酶的處理能力大約是Pfu DNA聚合酶的10倍,是Taq DNA聚合酶的2倍。這種強大的處理能力不僅縮短了延伸時間,而且提高了酶的擴增性能,使其能夠在更短的時間里擴增更長的模板。另外,與傳統的具有校對功能的聚合酶相比,Phusion® DNA聚合酶用量更少,而產量更高。正是這些獨特的優點,使Phusion® DNA聚合酶同時適用于常規PCR和要求較高的PCR。

        超保真——克隆好幫手

        如果你下一步打算克隆,那選Phusion® DNA聚合酶一定沒錯了。它的錯配率極低,是高保真PCR的理想選擇。利用改良的lacI方法檢測,在HF緩沖液中,該酶的錯配率為4x10-7。這個數值比Taq DNA聚合酶大約低50倍,比Pfu DNA聚合酶還要低6倍。需要提醒的是,Phusion® DNA聚合酶產生的是平末端的PCR產物,TA克隆的話可要加A。

        超快速——整體循環時間縮短

        一般的高保真聚合酶都是慢吞吞的家伙,速度遠不及Taq酶,但Phusion® DNA聚合酶卻不是這樣。它的獨特結構決定了每次與DNA結合時都能夠摻入更多的核苷酸,延伸速度高達15-30s/kb。其高處理能力大大縮短了延伸步驟的時間,進而縮短了整個反應過程。如果你還想更快,可以選擇Phusion® Flash High-Fidelity PCR Master Mix,每kb 堿基的延伸時間僅為15 秒或更少。

        由于其結構獨特,Phusion® DNA聚合酶的效率也非常高。在任何PCR反應中,該酶的用量顯著低于其他常見的聚合酶。Phusion® DNA聚合酶的高速度和高效率使得它能在最短時間內獲得高產量。

        超強勁——減少反應失敗幾率

        Finnzymes曾做過實驗,從Thermus sp.基因組文庫中隨機挑選16個克隆,并用3種不同的耐熱DNA聚合酶進行擴增。結果顯示,Phusion® DNA聚合酶具有強勁的性能和速度,它能夠成功擴增出隨機挑選的16個片段中的15個(94%),并且產量很高。而Pfu DNA聚合酶的成功率僅為56%,Taq DNA聚合酶成功率也才62%,二者的產量明顯低于Phusion® DNA聚合酶。而且從圖中可以看出,Phusion® DNA聚合酶的延伸時間和酶用量均顯著低于Pfu酶,與Taq相當,但產量更高。這些研究結果進一步證實了Phusion® DNA聚合酶的優異性能。

        超特異——減少非特異擴增

        如果你的模板比較復雜,建議選擇Phusion® 熱啟動II DNA聚合酶。這個第二代的Phusion® 酶在室溫時結合了一個Affibody®分子,因此活性被抑制,減少了反應過程中對DNA模板的非特異性擴增和PCR引物的降解。使用Phusion®熱啟動II DNA聚合酶,反應體系可在室溫條件下建立,也適用于高通量的自動化平臺。循環開始后,獨特的熱啟動技術讓酶瞬時激活,開始擴增。而且Affibody分子對退火溫度也沒啥嚴格要求,這樣就能使用多種引物,包括那些熔解溫度較低的引物。

        有了這一手好牌,相信你對PCR應該滿懷信心了吧。別急,還有兩個好東西要介紹給你。要想實驗的進程更快,PCR本身是一方面,上游的樣品制備也需要耗費不少時間。核酸抽提,再跑個電泳,半天就過去了。因此,研究人員也在不斷開發新的產品,試圖跳過樣品制備,直接從樣品開始PCR。Finnzymes就不久前推出了幾個這樣的產品。

        Phusion® Blood Direct PCR Kit(Phusion® 血液樣品直接PCR 試劑盒)就是為全血中DNA的擴增而設計的。它在PCR前無需純化DNA或進行樣品前處理。試劑盒中含有上面提到的Phusion® 熱啟動高保真DNA聚合酶,適合保真度要求高的實驗。此酶摻入率高,聚合能力強,對血液中存在的抑制劑具有極強的耐受能力,甚至當血液濃度高達 40% 時依然保持活性。Phusion® 血液樣品直接PCR 試劑盒包含一整套的優化試劑和對照引物,能夠對多種血液樣品進行分析。

        試劑盒中的反應組分均針對血液PCR進行了優化,且與高性能的DNA聚合酶配合使用,能確保多數血液樣品都能夠得到卓越的PCR結果,這些樣品包括:含有肝素、檸檬酸和 EDTA的血液樣品、保存于不同類型的濾紙上的血液樣品,甚至是經過防腐劑處理的血液樣品。此外,試劑盒還可處理來源于不同種屬的血液樣品。

        對于眾多的植物學研究人員,同樣有一個專為他們開發的試劑盒——Phire® Plant Direct PCR Kit(Phire® 植物樣品直接PCR試劑盒)。它能從植物樣品中直接擴增DNA,而無需預先抽提。試劑盒采用的是Phire® 熱啟動II DNA聚合酶,該酶是一種特殊的工程化酶,帶有獨特的DNA結合域。Phire® DNA聚合酶性能特別強勁,能夠耐受植物樣品中存在的多種抑制劑。試劑盒包含一整套的優化試劑,制樣工具和對照引物,使其成為擴增植物DNA的簡單而便捷的選擇。當與Piko® 熱循環儀和UTW® 管配合使用時,PCR過程在短短30分鐘內即可完成。

        針對不同目的,有兩種實驗方案可供選擇。在直接PCR方案中,取少量植物樣品,直接置入PCR反應混合物,即可進行PCR反應。在稀釋方案中,將含有碾碎的植物樣品的稀釋緩沖液,取少量加入PCR反應混合物中。稀釋方案可用于長片段或難擴增的片段,以及從同一樣品中擴增多個DNA片段的實驗。

        目前已對多種植物葉片和種子進行過測試,詳見http://www.finnzymes.com/pdf/materials_tested_with_phire_plant_directpcr_kit.pdf

        有了Phusion® DNA聚合酶及眾多試劑盒的協助,相信PCR不再是難題了吧。Finnzymes還在不斷推出更多的直接PCR試劑盒,欲了解最新動態,請關注生物通,或點擊索取最新資料。(生物通 余亮)

         

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