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Science:新測序方法解析人體“第二基因組”
【字體: 大 中 小 】 時間:2013年07月04日 來源:生物通
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來自華盛頓大學圣路易斯分校,耶魯大學等處的研究人員發表了題為“The Long-Term Stability of the Human Gut Microbiota”的文章,針對被稱為人體“第二基因組”的腸道微生物組展開了研究,研究人員利用一種稱為LEA-seq的方法,對多個個體糞便中的微生物組進行了分析,從中解析了腸道微生物組的穩定性。
生物通報道:來自華盛頓大學圣路易斯分校,耶魯大學等處的研究人員發表了題為“The Long-Term Stability of the Human Gut Microbiota”的文章,針對被稱為人體“第二基因組”的腸道微生物組展開了研究,研究人員利用一種稱為LEA-seq的方法,對多個個體糞便中的微生物組進行了分析,從中解析了腸道微生物組的穩定性。這一研究成果公布在Science雜志上。
人體內有兩個基因組,一個是從父母那里遺傳來的人基因組;另一個則是出生以后才進入人體、特別是腸道內的多達1000多種的共生微生物,其遺傳信息的總和叫“微生物組”,也可稱為“元基因組”,相當于人的第二個基因組,它們所編碼的基因有100萬個以上。兩個基因組相互協調、和諧一致,保證了人體的健康。
早在2007年,美國國立衛生研究院就出資1億多美元啟動了人類微生物組路線圖計劃,日本也啟動了人類元基因組研究計劃。近年來這些研究也取得了一些成果,如去年Nature就公布了一項大型微生物組的研究成果,研究人員對來自非洲、南美和美國的531份人類糞便樣本展開了研究,揭示了隨著年齡人類腸道微生物的改變以及在不同國家人群中的差異。
在這項研究中,研究人員則主要針對37人的糞便樣品展開了研究,他們開發出了一種LEA-seq的方法,這種方法通過改進提高了誤差率,能用于追蹤腸道中細菌群落的變化情況,從而有助于科學家們了解這些細菌隨著時間的推移,而出現的各種變化。
從中研究人員發現樣品中有60%的細菌菌株在長達5年的時間中仍然保持著穩定,由此研究人員推測某些菌株甚至會持續不變幾十年。此外研究人員還通過比較相關及不相關個體的全部微生物基因組,發現家庭成員共同擁有某些相同的微生物株,這表明人體在很早的時候通過父母而得到的微生物株能夠為整個一生提供他們的代謝產物。
研究人員還分析比較了腸道微生物組在攝入特別飲食而減肥的時候,以及不同時間段的變化,結果發現,體重減輕對微生物組的改變比時間的推移要有更明顯的影響。這說明腸道微生物群的改變可作為宿主健康及功能的標志物。
這些研究成果不僅可用于指導健康指標,而且這種新技術也有助于為了個體化醫療的實現。
(生物通:張迪)
原文標題:
The Long-Term Stability of the Human Gut Microbiota