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Circulation Research:Arraystar LncRNA芯片研究循環性生物標記物
【字體: 大 中 小 】 時間:2015年01月08日 來源:康成生物
德國漢諾威醫學院分子與轉化治療策略研究所的Thomas Thum博士課題組,主要從事心血管疾病和移植醫學中基于非編碼RNA治療策略的研究。近期,其實驗室利用Arraystar Human LncRNA 芯片研究發現了一種新的血漿lncRNA-LIPCAR,在早期心肌梗死(心梗)后左室重塑病人、晚期心梗后左室重塑病人、病情更嚴重的慢性心臟衰竭(心衰)病人中表達量逐步增高;以及生存期短的心衰病人較生存期長的病人,其LIPCAR的表達也顯著增高。這些研究為心臟重塑預后及心衰病人的存活期預測提供了新的潛在生物標記物。該研究成果刊登在國際權威期刊Circulation Research(影響因子11.089)。(芯片實驗由Arraystar提供技術服務)
研究背景:
心血管疾病是致使人類死亡的主導原因。相較于在致病機制和治療等方面取得的進步,其診斷手段仍舊匱乏。近期研究表明,不同病狀的心衰通過lncRNA的表達譜可得以區分。然而,卻未有用于心臟疾病診斷的血漿lncRNA的相關研究報道。Thomas Thum博士課題組本次研究目的是利用Arraystar Human LncRNA 芯片對血漿lncRNA作為預測心衰病人生存期的潛在生物標記物展開了系統研究。
研究思路:
為了系統檢測心梗后左室重塑病人中lncRNA的表達變化,作者首先應用美國Arraystar Human LncRNA芯片檢測了早期心梗后左室重塑病人和未重塑病人血漿中的lncRNA表達變化。借助于聚類分析和分子生物學手段,確認了血漿lncRNA-LIPCAR 在早期心梗后左室重塑病人中低表達,晚期時高表達。
作者進一步研究血漿lncRNA-LIPCAR在心衰病人中的表達水平,發現病情更嚴重的慢性心衰病人較晚期心梗后左室重塑病人,其LIPCAR的表達更高;生存期低于3年的心衰病人較生存期高于3年的病人,其LIPCAR表達量更高。
技術路線:

結果展示:


A. 聚類圖顯示差異表達的lncRNA(左圖),火山圖顯示差異表達的lncRNA(右圖);
B. qPCR結果表明,生存期低于3年的心衰病人較生存期高于3年的病人,其LIPCAR表達量更高。
研究意義:
該研究揭示了血漿中的lncRNA的異常表達變化與心臟疾病病人的疾病程度相關聯。在早期心梗后左室重塑病人中血漿lncRNA-LIPCAR低表達,晚期時高表達,而病情更嚴重的慢性心衰病人中的表達量則更高;生存期低于3年的心衰病人較生存期高于3年的病人,其LIPCAR表達量也更高。該研究對于揭示血漿lncRNA-LIPCAR在心臟疾病中行使的功能的研究提供了理論基礎,為心臟重塑預后及心衰病人生存期的預測提供了潛在的生物標記物。
原文出處:
Circulating Long Noncoding RNA, LIPCAR, Predicts Survival in Patients With Heart Failure. Circulation Research. 2014,114(10):1569-75.
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