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        2014創新產品:全新SNP基因分型平臺

        【字體: 時間:2015年02月13日 來源:生物通

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          在推出不少好產品后,Fluidigm創新的腳步并未停歇。2014年,它又推出了全新的SNP基因分型平臺 – Juno系統。它能在不到3小時的時間內處理并完成低至2.5ng/ul的DNA樣本的SNP基因分型(比如組織,口腔拭子,血,石蠟包埋組織和多倍體生物),有效突破了基因分型領域目前對高濃度、高質量DNA要求的瓶頸。

        過去6年,生物通一直在追蹤生命科學領域最前沿的創新產品,將其介紹給大家。2014年,生物通繼續搜羅新上市的產品,為大家奉上一場技術盛宴。經過一個半月的網頁和微信投票以及專家評鑒,2014生命科學十大創新產品終于出爐。

        Fluidigm,這家致力于單細胞生物學的公司推出了不少創新性的產品,包括C1單細胞自動制備系統,以及新收購的CyTOF 2質譜流式細胞儀,這兩個產品分別在2012和2013年被生物通讀者評為生命科學創新產品。

        然而,Fluidigm創新的腳步并未停歇。2014年,它又推出了全新的SNP基因分型平臺 – Juno系統。它能在不到3小時的時間內處理并完成低至2.5ng/ul的DNA樣本的SNP基因分型(比如組織,口腔拭子,血,石蠟包埋組織和多倍體生物),有效突破了基因分型領域目前對高濃度、高質量DNA要求的瓶頸。

        基于此,Juno系統當選2014年度的生命科學創新產品。為了讓大家更好地了解Juno系統以及Fluidigm的其他新產品,生物通采訪了Fluidigm中國公司的業務經理。

        Q:與傳統的基因分型平臺相比,Juno系統有哪些優勢?

        A:SNP基因分型的傳統方法使用微流控芯片或者微量滴定板(這需要相當量的試劑從而導致很高的成本)和高濃度,高質量的樣本。高成本和樣本的高質量的限制阻礙了在生產基因組學中使用例如口腔拭子和石蠟包埋組織等低濃度DNA樣本。

        Fluidigm公司的Juno系統第一次使用了一種微流控芯片技術,它在一塊芯片上整合了預擴增和基因分型,能對高達96個樣本和96個位點進行基因分型。為了解決傳統SNP基因分型實驗的限制,新的芯片只需要5.5ng的DNA,濃度為2.5ng/ul。

        Juno平臺在降低使用開放型的微量滴定板做多步驟的實驗流程中存在的錯誤和PCR污染的風險的同時,大大縮短數據采集的時間。雖然市場上的其他解決方案需要多次動手步驟并且從樣本到數據的時間至少是5小時,但是一步法的,全自動的Juno系統的工作流程只需要15分鐘準備試劑,在不到3小時的時間內就能拿到數據。Juno平臺的靈活性和易用性將使核心實驗室可以簡單地滿足許多不同客戶的需求,并且系統在一塊芯片上整合預擴增和基因分型的能力將使臨床實驗室能經濟地從低濃度DNA樣本中獲得快速和準確的結果。

        Q:Juno系統在什么時候上市?適用于哪些研究領域?

        A:Juno系統已于2014下半年度上市,并已在中國售出四臺。它的目標用途包括生物樣品庫和細胞培養機構的樣品識別、質控和DNA指紋鑒定的應用,以及農業生物學客戶在芯片原位的預擴增和基因分型的應用。

        Q:針對NGS,Fluidigm也推出了不少產品,能不能簡單介紹一下。

        A:FLUIDIGM公司的捕獲芯片系統(Access Array System)與第二代重測序相結合成為一種強有力的方法,可以對成百甚至更多的樣品進行SNP鑒定、序列多樣性和突變檢測、DNA甲基化檢測、外顯子測序等。重測序的應用只需對感興趣的目標序列區段在多個樣品中進行測序,比每個樣品進行全基因組測序更便宜有效且易于分析。要充分發揮第二代測序高通量的潛力要求快速而簡便的制備目標序列的測序文庫。目前市面上目標序列重測序的技術大都集中對較少數的DNA樣品中捕獲感興趣的長片段序列,每個樣品需要消耗大量的DNA,而且制備的測序文庫中不同目標區段的相對含量很不均一。

        這是第一個可以和目前所有主要的第二代測序系統相匹配的高通量目標區段富集系統。用戶可以從大量的樣品中一次性地富集數百個不同的區段序列(例如外顯子)。這個系統充分結合了微流體技術的成本和通量優勢以及PCR的高效性及靈活性。

        我想了解Juno基因分型系統的更多信息和報價

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