生物通報(bào)道  測序公司10x Genomics近日宣布收購表觀遺傳學(xué)初創(chuàng)公司Epinomics。據(jù)介紹，此次收購將為10x Genomics帶來ATAC-seq技術(shù)和相關(guān)知識(shí)產(chǎn)權(quán)，從而加速表觀基因組學(xué)研究，為深入了解疾病的診斷和治療鋪平道路。

ATAC-seq（染色質(zhì)開放性測序技術(shù)）是一種利用轉(zhuǎn)座酶來研究全基因組范圍內(nèi)染色質(zhì)開放性的方法，于2013年10月在《Nature Methods》雜志上首次發(fā)表。它僅需少量細(xì)胞，通過簡單的兩步法操作即可捕獲染色質(zhì)的開放區(qū)域，適用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合分析、核小體定位、活性調(diào)控元件分布等研究。

10x Genomics的CEO Serge Saxonov解釋說：“它為評(píng)估染色質(zhì)開放區(qū)域帶來了一種相當(dāng)直觀的方法。基因組是所有可能事物的集合；開放染色質(zhì)定義了細(xì)胞實(shí)際上干了什么。在我看來，ATAC-seq準(zhǔn)確地獲得了：哪些區(qū)域是開放的，哪些區(qū)域是關(guān)閉的。”

這篇論文的三位作者 – 斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的教授Howard Chang、助理教授Will Greenleaf，以及Paul Giresi是開發(fā)ATAC-seq技術(shù)的主要貢獻(xiàn)者。2013年，他們聯(lián)合斯坦福商學(xué)院的MBA Fergus Chan創(chuàng)立了Epinomics公司。

Epinomics的專利組合包括與ATAC-seq相關(guān)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)。10x Genomics公司表示，Epinomics的知識(shí)產(chǎn)權(quán)與它現(xiàn)有的專利組合互補(bǔ)。同時(shí)，Chan、Giresi以及Epinomics團(tuán)隊(duì)將立即加入10x Genomics，而Chang和Greenleaf將擔(dān)任10x Genomics的科學(xué)顧問。

Saxonov認(rèn)為ATAC-seq有著廣泛的應(yīng)用前景，并與10x Genomics的單細(xì)胞基因表達(dá)產(chǎn)品互補(bǔ)。他認(rèn)為，這項(xiàng)技術(shù)將應(yīng)用在各個(gè)領(lǐng)域，最早是腫瘤學(xué)和免疫腫瘤學(xué)。

Epinomics一直在發(fā)掘這項(xiàng)技術(shù)的臨床應(yīng)用，包括利用表觀基因組的特征來預(yù)測對免疫療法的反應(yīng)。同時(shí)，它也與斯坦福大學(xué)的Parker癌癥免疫治療研究所合作，利用生物標(biāo)志物和表觀基因組學(xué)技術(shù)來改善癌癥免疫療法。

10x Genomics正著手將Epinomics的表觀遺傳學(xué)技術(shù)與其自身的Chromium Single Cell ATAC Solution相整合，預(yù)計(jì)在今年年底前推出。

Saxonov表示，內(nèi)測用戶非常滿意。“隨著時(shí)間的推移，我們將分享更多數(shù)據(jù)，”他承諾。“這些數(shù)據(jù)看起來很棒；科學(xué)非常有趣。”

Epinomics是10x Genomics的第一個(gè)收購對象，但Saxonov承諾會(huì)有更多。“我們的目標(biāo)是建立一家大規(guī)模的公司。作為一種手段，如果我們遇到了偉大的技術(shù)、偉大的公司、偉大的團(tuán)隊(duì)，那我們將考慮收購，”他說。（生物通 薄荷）

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• 了解到如何利用Chromium Single Cell ATAC方案，以單細(xì)胞分辨率繪制表觀遺傳全景圖。
• 了解到斯坦福大學(xué)人體動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)物組中心的主任Howard Chang教授（ATAC-Seq技術(shù)的共同發(fā)明人）如何利用Chromium Single Cell ATAC方案作為一種簡便靈敏的方法來繪制基因調(diào)控圖譜。

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