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如何實現準確的單細胞轉錄本異構體檢測?
【字體: 大 中 小 】 時間:2022年12月08日 來源:
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PacBio推出的MAS-Seq for 10x Single Cell 3'試劑盒提供了一種端到端解決方案,可用于從樣品制備到生物信息學分析的單細胞RNA異構體測序。MAS-Seq文庫與常規單細胞Iso-Seq文庫相比,可使通量提高16倍。
單細胞RNA測序(scRNA-seq) 能夠表征源自復雜組織的單個細胞之間的基因表達差異,提供更高分辨率的轉錄組信息。大多數單細胞實驗都是使用短讀長完成的,由于文庫必須片段化,所以短讀長測序只能捕獲分子的各端,測序數據只能在基因水平上提供表達信息,缺少可能對疾病或生物功能十分關鍵的重要異構體多樣性信息。而其他長讀長技術識別唯一分子標簽 (UMI) 和細胞條形碼 (CBC) 的準確率不夠。HiFi測序技術的出現不僅能對全長RNA異構體進行測序,還能識別單細胞條形碼和UMI信息,在單細胞水平上揭示異構體多樣性,讓我們以全新方式深入了解單細胞生物學。
PacBio推出的MAS-Seq for 10x Single Cell 3'試劑盒處理單細胞cDNA可以得到一個可用于HiFi測序的文庫,您可以實現:
▪ 與常規單細胞Iso-Seq文庫相比,MAS-Seq文庫可使通量提高16倍。
▪ 從基因表達到獲得全長isoform信息
▪ 在單細胞水平上揭示RNA異構體多樣性
▪ 揭示細胞類型特異性isoform和表達差異