Element Biosciences公司近日發(fā)布了他們的第一款測序儀——Element AVITI系統(tǒng)，這是一款臺式測序儀，能夠提供出色的性能、更低的成本和更高的靈活性。

據(jù)悉，Element專有的Avidity短讀長測序試劑能夠帶來其他臺式系統(tǒng)無法比擬的準確性和成本效益。AVITI系統(tǒng)可獨立運行兩個流動槽，為用戶帶來極大的靈活性。AVITI操作軟件也具有可調節(jié)讀取通量的功能，在運行時間方面帶來了更多的靈活性。

AVITI系統(tǒng)的主要參數(shù)如下：

▪ 2x150 bp雙端讀長
▪ 2x150 bp讀長下的Q30 > 90%
▪ 每個流動槽可產(chǎn)生800M+雙端reads
▪ 每個流動槽可產(chǎn)生240 Gb數(shù)據(jù)
▪ 2個隨機存取流動槽，總共可產(chǎn)生480 Gb數(shù)據(jù)
▪ 13-48個小時的運行時間
▪ 每Gb成本5-7美元（由流動槽產(chǎn)量決定）

首席技術官Michael Previte在發(fā)布會上談到了Element是如何不斷改進的，其重點在于最大化信噪比：讓信號最大化，同時讓背景最小化。他還強調了兩個獨立流動槽帶來的靈活性，認為“它本質上是一臺儀器內有兩個測序系統(tǒng)，你可以啟動一側的流動槽，然后待會兒回來再啟動另一個。”Previte還表示，該系統(tǒng)未檢測出標簽跳躍（index hopping）。

同時，Element還與NGS文庫制備和生物信息學領域的多家公司合作，包括安捷倫、QIAGEN、NEB、羅氏、10x Genomics等。這些被稱為創(chuàng)新合作伙伴的早期客戶將獲得2個免費的試劑盒和一年額外保修。

Element Biosciences公司的首席執(zhí)行官兼聯(lián)合創(chuàng)始人Molly He表示：“隨著AVITI系統(tǒng)的推出，Element正在實現(xiàn)其愿景，即普及高質量、低成本且易用的基因組學工具。通過最近對Loop Genomics的收購，我們將在一個平臺上同時提供短讀長和長讀長測序功能。AVITI將為用戶帶來前所未有的自由度和靈活性。”

今年2月，Element Biosciences宣布已完成對Loop Genomics的收購。通過將Element的高精度短讀長測序平臺與Loop的簡單且可擴展的長讀長解決方案相結合，客戶將能夠在同一平臺上實現(xiàn)短讀長和長讀長應用。

Loop Genomics的創(chuàng)始人Tuval Ben-Yehezkel現(xiàn)已加入Element Biosciences。他解釋了如何利用短讀長測序儀來實現(xiàn)長讀長測序，以解決定相問題。主要是在樣本上添加獨特分子標識符（UMI），以了解哪些變異與同一條核酸鏈相關聯(lián)。在測序獲得短讀長后，通過軟件重新組裝，然后推斷原始的長序列，也就是“合成長讀長”。

剛剛加入Element并擔任應用和科學事務高級副總裁的Shawn Levy表示：“在Beta測試中，文庫兼容性和測序性能都和我們預期的一樣好。采用AVITI系統(tǒng)的用戶可對工作流程和數(shù)據(jù)質量充滿信心。”Levy之前曾在Hudson Alpha研究所參與AVITI系統(tǒng)的測試工作。

Element目前已發(fā)布了七份應用指南和技術指南，以及五個可供下載的測序數(shù)據(jù)集，覆蓋人類全基因組、細菌全基因組和RNA-seq分析。公司現(xiàn)已開始接受AVITI系統(tǒng)的訂單，預計從2022年第二季度開始發(fā)貨。

AVITI測序儀的定價為28.9萬美元。不過，Molly He表示他們可能會提供批發(fā)價。“我們正在考慮基于數(shù)量的折扣。這將是透明的。”