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PacBio重磅推出Kinnex系列試劑盒
【字體: 大 中 小 】 時(shí)間:2023年12月20日 來(lái)源:基因有限公司
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基于Kinnex試劑盒,您可以高度準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)蛋白質(zhì),識(shí)別異構(gòu)體,表征剪接事件,把單細(xì)胞UMI和barcode 追溯回特定細(xì)胞,以及實(shí)現(xiàn)種水平的微生物群落分析。
Kinnex試劑盒采用MAS-Seq串聯(lián)的方式,通過將短的全長(zhǎng)cDNA或全長(zhǎng)16S擴(kuò)增子串聯(lián)成一個(gè)長(zhǎng)文庫(kù),可大幅提高PacBio長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序系統(tǒng)的通量。Kinnex試劑盒包括Kinnex 全長(zhǎng)RNA試劑盒、Kinnex單細(xì)胞RNA試劑盒以及Kinnex全長(zhǎng)16S rRNA試劑盒三種;贙innex試劑盒,您可以高度準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)蛋白質(zhì),識(shí)別異構(gòu)體,表征剪接事件,把單細(xì)胞UMI和barcode 追溯回特定細(xì)胞,以及實(shí)現(xiàn)種水平的微生物群落分析。

Kinnex試劑盒可用于:
1. 基于Iso-Seq的全長(zhǎng)RNA測(cè)序
傳統(tǒng)的RNA-Seq將cDNA片段化后用于短讀長(zhǎng)測(cè)序(100-200 bp),必須通過算法來(lái)推斷原始的轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體。然而,由于可變剪切事件的復(fù)雜性,許多異構(gòu)體具有高度相似的結(jié)構(gòu),推斷出的轉(zhuǎn)錄本不準(zhǔn)確。PacBio HiFi的Iso-Seq可對(duì)全長(zhǎng)RNA異構(gòu)體進(jìn)行測(cè)序,無(wú)需進(jìn)行cDNA片段化和轉(zhuǎn)錄本組裝,能夠準(zhǔn)確檢測(cè)全長(zhǎng)異構(gòu)體。

PacBio Kinnex全長(zhǎng)RNA試劑盒
以總RNA作為起始樣本,輸出一個(gè)可直接用于測(cè)序的文庫(kù),您可以實(shí)現(xiàn):
與典型的Iso-Seq文庫(kù)相比,其通量提高了8倍。
從5'端到3'端全長(zhǎng)異構(gòu)體測(cè)序;
準(zhǔn)確表征剪接位點(diǎn);
可發(fā)現(xiàn)新基因和新異構(gòu)體,鑒定融合基因;
獲得異構(gòu)體read計(jì)數(shù)信息。
2. 單細(xì)胞RNA測(cè)序

PacBio Kinnex單細(xì)胞RNA試劑盒處理單細(xì)胞cDNA可以得到一個(gè)可用于HiFi測(cè)序的文庫(kù),您可以實(shí)現(xiàn):
支持10x Chromium單細(xì)胞3'試劑盒(v3.1)和5'試劑盒(v2)產(chǎn)生的cDNA;
與常規(guī)單細(xì)胞Iso-Seq文庫(kù)相比,單細(xì)胞MAS-Seq文庫(kù)可使通量提高16倍;
獲得基因表達(dá)及全長(zhǎng)isoform信息,更好地識(shí)別轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS)和多聚腺苷酸化(polyA)位點(diǎn);
在單細(xì)胞水平上揭示RNA異構(gòu)體多樣性,有助于發(fā)現(xiàn)新的異構(gòu)體;
檢測(cè)癌癥中的表達(dá)突變和融合轉(zhuǎn)錄本。

3. 全長(zhǎng)16S擴(kuò)增子測(cè)序
全長(zhǎng)16S擴(kuò)增子測(cè)序?yàn)榭膳囵B(yǎng)以及難培養(yǎng)的微生物基因組研究提供了更全面和更高質(zhì)量的數(shù)據(jù):
減少序列相似性,檢測(cè)更多的核苷酸差異,以獲得更好的分類分辨率區(qū)分關(guān)鍵物種和菌株;
揭示樣本的真正多樣性。

PacBio Kinnex 16S rRNA試劑盒在保持菌種水平分辨率的基礎(chǔ)上,用MAS-Seq方法提高了PacBio長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序儀的通量,您可以進(jìn)一步實(shí)現(xiàn):
通量提高12倍,更具性價(jià)比;
獲得更高分辨率和更高質(zhì)量的全長(zhǎng)16S分析。
是什么讓Kinnex與眾不同?
成本效益+創(chuàng)新技術(shù):基于現(xiàn)有的PacBio測(cè)序方法,Kinnex試劑盒允許將短片段(cDNA/16S rRNA)連接成長(zhǎng)片段文庫(kù),優(yōu)化HiFi測(cè)序,提升性價(jià)比。

基因有限公司作為PacBio公司中國(guó)區(qū)合作伙伴,自2011年以來(lái)將PacBio第三代單分子實(shí)時(shí)測(cè)序技術(shù)引入國(guó)內(nèi),一直為國(guó)內(nèi)用戶提供專業(yè)的三代測(cè)序系統(tǒng)的安裝培訓(xùn),技術(shù)支持,應(yīng)用培訓(xùn)與售后維護(hù)工作,贏得客戶的一致好評(píng)與信任;蛴邢薰緦⒁蝗缂韧闹С衷絹(lái)越多的PacBio用戶。
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