2023年度基因組生物學(xué)技術(shù)進(jìn)展大會（AGBT）于2月初在美國佛羅里達(dá)州好萊塢舉行。作為全球基因組學(xué)研究界公認(rèn)的盛會，AGBT大會為交流DNA測序技術(shù)的最新進(jìn)展、基因組學(xué)研究的實(shí)驗(yàn)和分析方法提供了一個絕佳的平臺。在此次大會上，空間生物學(xué)成為人們關(guān)注的熱點(diǎn)。

空間生物學(xué)領(lǐng)域的先鋒NanoString和10x Genomics都在今年的AGBT大會上展示了其第二個空間平臺。對于這兩家公司來說，第一個平臺的推出是為了發(fā)現(xiàn)，以較低分辨率觀察組織切片上的大量基因。如今，第二個互補(bǔ)平臺的推出是為了更深入挖掘具體問題，可以更詳細(xì)地觀察較少基因。

NanoString公司之前推出了GeoMx數(shù)字空間分析平臺，其目的是全面觀察所有基因。如今，它又推出了CosMx SMI單細(xì)胞空間原位分子成像系統(tǒng)。它能夠?qū)�組織切片中1,000多種RNA分子進(jìn)行單細(xì)胞和亞細(xì)胞水平的超高分辨率成像。NanoString的想法是用GeoMx獲得一幅整體畫面，再用CosMx進(jìn)行更深入的挖掘。

據(jù)介紹，CosMx SMI系統(tǒng)的檢測靶標(biāo)范圍有望在明年從目前的 1,000 種 RNA 和 60 多種蛋白拓展至 6,000 種 RNA 和 120 種蛋白。研究人員能夠在單細(xì)胞和亞細(xì)胞分辨率下對這些靶標(biāo)進(jìn)行表達(dá)定量分析和可視化觀察，從而在原生環(huán)境下對單個細(xì)胞進(jìn)行全面分析。

10x Genomics公司很早就推出了其空間平臺Visium。目前，這個平臺已被廣泛采用，許多文獻(xiàn)中的結(jié)果都是在Visium平臺上產(chǎn)生的。不過，Visium的分辨率不太高，并非單細(xì)胞。因此，10x Genomics推出了Xenium原位分析平臺，它能夠深入分析400個靶標(biāo)，未來也許能增加到1,000個。

據(jù)10x的首席技術(shù)官M(fèi)ichael Schnall-Levin博士介紹，Xenium的核心來自公司幾年前收購Readcoor和Cartana公司時獲得的技術(shù)。他回憶道，當(dāng)時10x Genomics一直在考慮建立自己的高分辨率、單細(xì)胞空間儀器。公司從Readcoor和Cartana那里獲得了一些組件，并將它們重新打造成Xenium。

Resolve Biosciences雖然是一家小公司，但卻是AGBT大會的金牌贊助商。這家公司的核心技術(shù)是分子制圖（Molecular Cartography），也就是組合式單分子熒光原位雜交（smFISH），能夠讓研究人員了解腫瘤細(xì)胞的基因表達(dá)，同時更好地了解細(xì)胞的生存環(huán)境。

據(jù)悉，在過去的兩年里，Molecular Cartography技術(shù)在神經(jīng)學(xué)、腫瘤學(xué)、發(fā)育生物學(xué)及其他多個領(lǐng)域揭示了許多重要見解。這項(xiàng)技術(shù)已應(yīng)用在50多種組織類型上，并被15篇手稿和同行評審的文獻(xiàn)所引用。在此次大會上，Resolve Biosciences宣布將擴(kuò)展其端對端的Meridian服務(wù)計(jì)劃。

此外，在AGBT大會上，Akoya Biosciences公司也展示了他們最新的PhenoCycler-Fusion系統(tǒng)。以往，Akoya一直被認(rèn)為是一家蛋白質(zhì)空間公司，但PhenoCycler-Fusion的推出讓其進(jìn)入了轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域。Akoya指出，它的系統(tǒng)比其他系統(tǒng)周轉(zhuǎn)更快，而且具備多組學(xué)（RNA和蛋白質(zhì)）成像能力。

PhenoCycler-Fusion平臺能夠?qū)φ麖埥M織切片進(jìn)行多重的空間表型分析。它能在短短幾分鐘內(nèi)對多個生物標(biāo)志物和數(shù)百萬個細(xì)胞進(jìn)行成像，實(shí)現(xiàn)無偏向的空間表型分析。Akoya的首席商務(wù)官Niro Ramachandran博士預(yù)測，未來幾年內(nèi)，所有空間平臺都將具有多組學(xué)能力，能夠運(yùn)行100-1,000重檢測，并支持單細(xì)胞（或亞細(xì)胞）分析。