Microbacterium屬由Orla-Jensen首次建立（1），屬于Microbacteriaceae科，目前包含166個經過正式發表的物種（2），這些物種來源于多種不同的環境（3–5）。在研究茄子根際細菌多樣性過程中，分離出了一種新的Microbacterium屬菌株，命名為Microbacterium sp. MAHUQ-60，并在本研究中展示了其基因組草圖。細菌基因組測序是一項具有廣泛應用價值的技術，在醫學、公共衛生和進化研究中都具有重要意義（6–10）。

MAHUQ-60菌株是從韓國安城地區的一株茄子根際分離得到的。通過輕輕去除附著在植物根部的土壤來收集根際土壤樣本。將1克土壤樣本懸浮在9毫升無菌0.85%（重量/體積）NaCl溶液中，然后逐級稀釋至10^?6濃度，將100微升稀釋液涂布在營養瓊脂（NA；Difco，BD，目錄號213000）平板上。隨后在30°C條件下培養3天。通過多次劃線傳代在新鮮NA平板上純化單菌落。根據16S rRNA基因序列分析，確定MAHUQ-60菌株屬于Microbacterium sp. MAHUQ-60。該菌株已存入中國普通微生物菌種保藏中心，保藏編號為CGMCC 1.60115。基因組DNA是從在營養肉湯（Difco，BD，目錄號234000）中培養24小時的細菌中提取的，使用Solgent（韓國）公司的基因組DNA提取試劑盒按照制造商的協議進行提取。利用AMPure XP珠子對DNA片段進行大小篩選，以獲得適合Illumina測序的標準長度（通常為200–300個堿基對）。使用Nextera XT DNA Library Prep Kit（Illumina，美國圣地亞哥）制備測序文庫。測序過程采用Illumina HiSeq 3000平臺，按照制造商提供的標準協議進行雙端2 × 150 bp讀取。使用FastQC（11）對讀取數據進行質量控制，并用Trimmomatic（12）去除接頭序列和低質量堿基。使用Illumina的bcl2fastq軟件v.2.20.0按默認參數對原始讀取數據進行去重并轉換為FASTQ格式。使用SOAPdenovo v.2.04組裝器（13）進行基因組組裝，并利用NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline v.6.3（14–16）進行基因組注釋。通過Type (Strain) Genome Server（https://tygs.dsmz.de）進行基于全基因組的分類分析。使用Genome-to-Genome Distance生物信息學工具（17）計算in silico DNA-DNA雜交值。與MAHUQ-60基因組最匹配的類型菌株是Microbacterium suwonense NBRC 106310（登錄號GCA_030296555），其in silico DNA-DNA雜交值為25.7%。

Microbacterium sp. MAHUQ-60的基因組長度為3,425,239 bp，GC含量為69.0%�；�因組由5個contigs組成，覆蓋率為112倍。共預測出3,253個基因，其中3,194個為蛋白質編碼基因�；�因組特征的詳細信息見表1。

特別感謝中國科學院微生物研究所下屬的世界微生物數據中心對MAHUQ-60菌株的基因組測序工作。

M.A.H.：概念設計、數據分析、撰寫（初稿、審閱和編輯）；M.Z.S.和M.M.R.：撰寫（審閱和編輯）。