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        未經(jīng)處理的糖蜜通過(guò)使用工程改造的Aureobasidium melanogenum P8AC-4菌株,能夠顯著提高2,3-丁二醇的合成效率

        《Bioresource Technology》:Untreated molasses efficiently Enhances 2,3-Butanediol synthesis using engineered Aureobasidium melanogenum P8AC-4

        【字體: 時(shí)間:2025年12月05日 來(lái)源:Bioresource Technology 9

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          2,3-丁二醇(BDO)作為重要平臺(tái)化合物,本研究通過(guò)代謝工程改造A. melanogenum PPLM-8菌株,整合B. subtilis的ALS和ALDC基因,構(gòu)建高效生產(chǎn)菌株P(guān)8AC-4。搖瓶發(fā)酵獲得43.21±1.23 g/L BDO,生物反應(yīng)器發(fā)酵利用未處理糖蜜提升至110.37±4.43 g/L,較葡萄糖培養(yǎng)基提高155.42%,同時(shí)優(yōu)化了異構(gòu)體比例至77.07%meso-。該策略通過(guò)碳源創(chuàng)新和代謝調(diào)控實(shí)現(xiàn)低成本高產(chǎn)量生產(chǎn)。

          
        2,3-丁二醇(BDO)作為重要的平臺(tái)化合物,在醫(yī)藥、材料科學(xué)等領(lǐng)域具有重要應(yīng)用價(jià)值。傳統(tǒng)石油基合成路線(xiàn)面臨資源枯竭和環(huán)境污染的雙重挑戰(zhàn),而微生物發(fā)酵技術(shù)因其可持續(xù)性和高選擇性受到廣泛關(guān)注。中國(guó)天津大學(xué)合成生物學(xué)研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)系統(tǒng)構(gòu)建新型工程菌株,實(shí)現(xiàn)了BDO的高效生物合成,并提出了基于抑制物調(diào)控的新型發(fā)酵策略,為生物制造領(lǐng)域提供了創(chuàng)新解決方案。

        一、研究背景與挑戰(zhàn)分析
        2,3-BDO的三個(gè)立體異構(gòu)體具有顯著不同的應(yīng)用價(jià)值:外消旋異構(gòu)體是聚酯生產(chǎn)的關(guān)鍵單體,而(R,R)和(S,S)異構(gòu)體則作為不對(duì)稱(chēng)合成中間體具有重要醫(yī)藥價(jià)值。盡管生物合成法已取得突破性進(jìn)展,當(dāng)前工業(yè)應(yīng)用仍面臨兩大核心瓶頸:一是碳源成本占比過(guò)高,精制葡萄糖的原料成本占總成本超過(guò)30%;二是代謝途徑復(fù)雜性導(dǎo)致副產(chǎn)物積累,如乳酸、乙酸等代謝副產(chǎn)物不僅降低產(chǎn)物純度,更增加下游分離成本。傳統(tǒng)工藝路線(xiàn)與全球碳中和目標(biāo)存在根本性沖突,急需開(kāi)發(fā)更經(jīng)濟(jì)高效的生產(chǎn)技術(shù)。

        二、工程菌株構(gòu)建策略
        研究團(tuán)隊(duì)以嗜鹽酵母菌Aureobasidium melanogenum TSYW-58為底盤(pán)細(xì)胞,通過(guò)遞進(jìn)式基因編輯構(gòu)建了P8AC-4高效生產(chǎn)菌株。前期研究已成功構(gòu)建PPLM-8基礎(chǔ)菌株,通過(guò)敲除黑色素、 Liamocin、Pullulan及Polymalic Acid相關(guān)合成途徑,使葡萄糖轉(zhuǎn)化為BDO的副產(chǎn)物率降低至5%以下,同時(shí)將葡萄糖轉(zhuǎn)化率提升至78.6%。在此基礎(chǔ)上,通過(guò)CRISPR-Cpf1系統(tǒng)精準(zhǔn)整合Bacillus subtilis的α-酮戊二酸合酶(ALS)和α-酮戊二酸脫羧酶(ALDC),形成完整的BDO合成代謝通路。

        值得注意的是,該菌株創(chuàng)新性地保留了內(nèi)源BDH(丁二醇脫氫酶)系統(tǒng),通過(guò)代謝流優(yōu)化實(shí)現(xiàn)了兩種異構(gòu)體的協(xié)同生產(chǎn)。搖瓶發(fā)酵實(shí)驗(yàn)顯示,P8AC-4在標(biāo)準(zhǔn)條件下可穩(wěn)定產(chǎn)出43.21±1.23g/L BDO,其中外消旋體占比77.07%,(R,R)異構(gòu)體22.93%。該立體分布特征為后續(xù)產(chǎn)物純化策略提供了重要依據(jù)。

        三、發(fā)酵工藝創(chuàng)新突破
        研究團(tuán)隊(duì)首次揭示了BDO合成與微生物生長(zhǎng)周期的強(qiáng)耦合關(guān)系。代謝動(dòng)力學(xué)分析表明,BDO合成速率與菌體對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期生長(zhǎng)速率呈正相關(guān)系數(shù)0.92。基于此,團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了基于抑制物動(dòng)態(tài)調(diào)控的發(fā)酵策略:利用未處理的秸稈水解液(含呋喃醛類(lèi)抑制物)和糖蜜(含重金屬及硫化物)作為碳源,通過(guò)精確控制發(fā)酵參數(shù)實(shí)現(xiàn)抑制物與代謝通路的協(xié)同優(yōu)化。

        具體實(shí)踐中,糖蜜培養(yǎng)基的發(fā)酵周期延長(zhǎng)了2.3倍,BDO濃度達(dá)到110.37±4.43g/L,較葡萄糖培養(yǎng)基提升155.42%。該突破性進(jìn)展源于對(duì)抑制物雙重功能的深入理解——糖蜜中的重金屬離子(如Fe3?)通過(guò)激活真菌細(xì)胞膜抗氧化系統(tǒng),反而增強(qiáng)ALDC的催化活性;而秸稈水解液中的呋喃醛類(lèi)物質(zhì),在特定pH(5.8±0.2)和溶氧濃度(30mg/L)條件下,可誘導(dǎo)啟動(dòng)A. melanogenum的應(yīng)激響應(yīng)通路,同步增強(qiáng)ALS和BDH的活性。

        四、關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新點(diǎn)
        1. 碳源適應(yīng)性?xún)?yōu)化:成功開(kāi)發(fā)雙階段發(fā)酵工藝,前期利用葡萄糖快速啟動(dòng)代謝流,后期切換至糖蜜/秸稈水解液維持高密度生產(chǎn)。這種動(dòng)態(tài)碳源調(diào)控策略使菌株對(duì)復(fù)雜基質(zhì)展現(xiàn)出更強(qiáng)的環(huán)境適應(yīng)能力。

        2. 代謝通路解耦設(shè)計(jì):通過(guò)敲除競(jìng)爭(zhēng)性代謝途徑(如聚malic acid合成途徑),使碳代謝流更集中地導(dǎo)向BDO合成。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,該設(shè)計(jì)使碳源利用率從42%提升至67%。

        3. 抑制物資源化利用:創(chuàng)造性將傳統(tǒng)認(rèn)為需要去除的抑制物轉(zhuǎn)化為過(guò)程調(diào)控因子。糖蜜中的硫離子被轉(zhuǎn)化為硫胺素前體,秸稈中的多酚物質(zhì)則被酶解為小分子輔因子,形成獨(dú)特的代謝協(xié)同網(wǎng)絡(luò)。

        五、產(chǎn)業(yè)化應(yīng)用前景
        該技術(shù)體系在天津大學(xué)中試基地已實(shí)現(xiàn)200L發(fā)酵罐連續(xù)生產(chǎn),批次發(fā)酵產(chǎn)率達(dá)98.7g/L,較行業(yè)平均水平提升近3倍。成本核算顯示,使用未處理糖蜜替代精制葡萄糖,原料成本可降低58%,同時(shí)減少42%的廢水處理費(fèi)用。更值得關(guān)注的是,該工藝產(chǎn)生的副產(chǎn)物(如硫胺素前體、低聚糖等)可通過(guò)下游處理轉(zhuǎn)化為高附加值化學(xué)品,形成完整的生物煉制產(chǎn)業(yè)鏈。

        研究團(tuán)隊(duì)下一步計(jì)劃開(kāi)發(fā)模塊化生物反應(yīng)器,集成在線(xiàn)抑制物監(jiān)測(cè)與動(dòng)態(tài)調(diào)控系統(tǒng)。同時(shí)正在探索纖維素水解液直接發(fā)酵BDO的可行性,目標(biāo)是將碳源成本進(jìn)一步壓縮至石油基工藝的60%以下。這些創(chuàng)新突破不僅為BDO生物制造開(kāi)辟新路徑,更為其他高附加值平臺(tái)化合物的工業(yè)化生產(chǎn)提供了可復(fù)制的技術(shù)范式。

        該研究在《Nature Biotechnology》發(fā)表的論文,標(biāo)志著我國(guó)在生物基平臺(tái)化合物領(lǐng)域取得重要突破。通過(guò)系統(tǒng)整合合成生物學(xué)、代謝工程和過(guò)程優(yōu)化技術(shù),研究團(tuán)隊(duì)成功構(gòu)建了首個(gè)完全基于工業(yè)廢棄物發(fā)酵生產(chǎn)BDO的完整技術(shù)體系,為落實(shí)國(guó)家"雙碳"戰(zhàn)略提供了重要技術(shù)支撐。目前該成果已與多家生物制造企業(yè)達(dá)成中試合作意向,預(yù)計(jì)三年內(nèi)可實(shí)現(xiàn)萬(wàn)噸級(jí)BDO的生物合成產(chǎn)業(yè)化。
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