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利用簡單序列重復(SSR)標記對中國山楂(Crataegus L.)資源的遺傳多樣性和DNA指紋進行分析
《Genetic Resources and Crop Evolution》:Genetic diversity and DNA fingerprinting of Chinese hawthorn (Crataegus L.) resources using simple sequence repeat (SSR) markers
【字體: 大 中 小 】 時間:2026年01月08日 來源:Genetic Resources and Crop Evolution
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本研究基于SSR標記分析82份山楂種質資源遺傳多樣性,發現較高遺傳多樣性(Na=9.727,Ne=3.361,Ho=0.723),通過聚類和核心引物(Pr316、Pr224、Pr454)將其分為4組,不同引物區分能力差異顯著,為資源保護和育種提供依據。
山楂(Crataegus spp.)是一種具有多重園藝價值的植物,其用途包括食用、藥用、觀賞和經濟價值。盡管中國是山楂遺傳多樣性的主要中心,擁有豐富的資源,但這些資源的遺傳多樣性和DNA指紋特征仍缺乏詳細研究。本研究利用22個多態性簡單序列重復(SSR)標記,對82份山楂樣本(包括80份國內樣本和2份國外樣本)的遺傳多樣性、種群結構、主坐標分析及DNA指紋特征進行了分析。在種群水平上,觀察到的等位基因數(Na)為9.727,有效等位基因數(Ne)為3.361,香農信息指數(I)為1.426,觀察到的雜合度(Ho)為0.723,預期雜合度(He)為0.671,多態性信息含量(PIC)介于0.304至0.815之間,平均值為0.623,表明這些樣本具有相對較高的遺傳多樣性。22個SSR標記的鑒定概率(PI)和同胞鑒定概率(PIsibs)分別為3.67×10-19和2.38×10-8,證實了SSR標記在基因指紋鑒定中的強大區分能力。聚類分析、種群結構和主坐標分析(PCoA)將這些樣本共同分為四個主要組別。此外,還使用5個核心SSR引物對這82份樣本進行了DNA指紋分析。結果表明不同引物的區分能力存在差異:引物Pr316能夠區分19份樣本,而引物Pr224和Pr454分別能區分14份和13份樣本。本文分析了迄今未被報道的中國山楂種質的遺傳多樣性,并通過5個核心SSR標記建立了其DNA指紋圖譜,為未來的資源保護、開發和育種工作提供了支持。
山楂(Crataegus spp.)是一種具有多重園藝價值的植物,其用途包括食用、藥用、觀賞和經濟價值。盡管中國是山楂遺傳多樣性的主要中心,擁有豐富的資源,但這些資源的遺傳多樣性和DNA指紋特征仍缺乏詳細研究。本研究利用22個多態性簡單序列重復(SSR)標記,對82份山楂樣本(包括80份國內樣本和2份國外樣本)的遺傳多樣性、種群結構、主坐標分析及DNA指紋特征進行了分析。在種群水平上,觀察到的等位基因數(Na)為9.727,有效等位基因數(Ne)為3.361,香農信息指數(I)為1.426,觀察到的雜合度(Ho)為0.723,預期雜合度(He)為0.671,多態性信息含量(PIC)介于0.304至0.815之間,平均值為0.623,表明這些樣本具有相對較高的遺傳多樣性。22個SSR標記的鑒定概率(PI)和同胞鑒定概率(PIsibs)分別為3.67×10-19和2.38×10-8,證實了SSR標記在基因指紋鑒定中的強大區分能力。聚類分析、種群結構和主坐標分析(PCoA)將這些樣本共同分為四個主要組別。此外,還使用5個核心SSR引物對這82份樣本進行了DNA指紋分析。結果表明不同引物的區分能力存在差異:引物Pr316能夠區分19份樣本,而引物Pr224和Pr454分別能區分14份和13份樣本。本文分析了迄今未被報道的中國山楂種質的遺傳多樣性,并通過5個核心SSR標記建立了其DNA指紋圖譜,為未來的資源保護、開發和育種工作提供了支持。
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