7-脫氮腺苷的C7-磺酰胺功能化:具有Haspin抑制活性的sangivamycin類似物
《Chemical Communications》:C7-Sulfonamide functionalization of 7-deazaadenosines: sangivamycin analogues with Haspin inhibitory activity
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時間:2026年01月09日
來源:Chemical Communications 4.2
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磺酰胺基團在7-脫氧腺苷C7位成功安裝,開發出穩定磺酰氯中間體,建立通用合成方法,擴展核苷化學空間。新型磺酰胺基團化合物對Haspin激酶抑制活性達納摩爾級,具有高選擇性和抗腫瘤潛力。
本文聚焦于核苷化學領域的重要突破——首創性地在7-脫氧腺苷的C7位引入磺酰胺基團。該方法的核心創新在于開發了一種高度穩定的磺酰氯中間體(化合物7),突破了傳統磺酰氯化學不穩定的瓶頸。該中間體在常溫下可穩定保存6個月以上,其穩定性源于7-脫azapurine核心的電子密度顯著高于普通嘌呤核苷,有效抑制了磺酰氯的副反應路徑。
研究團隊通過系統性方法構建了完整的合成體系。以化合物4(苯酰保護的6-氯-7-碘-7-脫氧腺苷)為起始原料,經過多步反應最終獲得目標產物。關鍵步驟包括:1)碘代位的精準轉化形成胺基中間體;2)苯甲酰基的脫除為后續磺酰胺化創造空間位阻條件;3)創新性的磺酰氯合成工藝,采用N-氯代琥珀酰亞胺在乙酸水溶液中實現高效氯磺化。該工藝特別優化了催化劑的選擇,發現DMAP(二甲基氨基吡啶)兼具酸堿緩沖和催化雙重功能,相較于傳統堿如三乙胺或吡啶,能更有效地抑制副反應,提升產率。
在反應適用性方面,研究證實該體系具有廣泛的兼容性。實驗測試了30余種胺類衍生物的反應活性,成功合成了涵蓋芳香胺、脂肪胺、雜環胺及季銨鹽等多種官能團的磺酰胺產物。值得注意的是,當使用具有強吸電子基團(如吡啶環)的胺類時,反應活性顯著降低,這可能與磺酰氯的親核性受到電子效應抑制有關。特別在合成piperidine衍生物時,通過優化反應條件(如兩相溶劑體系DCM/H2O與復合堿的使用),實現了對位磺酰胺基團的選擇性引入。
生物活性評價部分揭示了該修飾策略的分子內涵。測試表明,引入磺酰胺基團后,Haspin激酶的抑制活性(IC50值)保持在20-30 nM水平,與原始化合物sangivamycin(7 nM)相當。結構活性關系(SAR)研究顯示:1)核苷骨架的剛性結構對活性至關重要,當C2位被取代時活性完全喪失;2)磺酰胺基團的空間構型需與激酶結合口袋的形狀匹配,因此氮原子上取代基的體積需控制在3-4 ?范圍內;3)糖環的2'-羥基和3'-羥基對維持活性構象具有關鍵作用,其缺失會導致活性顯著下降。
在方法學層面,該研究提出了"穩定中間體+精準定位"的核苷功能化新范式。通過對比實驗發現,傳統嘌呤核苷的磺酰氯在反應體系中30分鐘內即分解,而7-脫azapurine衍生物的磺酰氯穩定性提高約三個數量級。這種穩定性差異源于:1)7-脫氧結構中氮原子缺失導致電子云分布改變,C7位碳原子具有更高的親電性;2)硫原子與碘原子的空間位阻效應協同穩定了磺酰氯結構;3)糖環的剛性平面限制了磺酰氯的異構化反應。
應用拓展方面,研究團隊成功將該方法應用于多種新型核苷體系的改造。包括:1)2-取代型7-脫azapurines(化合物14、15),通過調整取代基的電子效應平衡活性與選擇性;2)偽腺苷結構(化合物16),采用環狀過渡態中間體實現高效轉化;3)卡巴環核苷(化合物19)等非經典核苷體系,驗證了該方法在復雜結構中的普適性。特別在合成化合物9a時,通過引入苯基磺酰胺基團,在保持Haspin抑制活性的同時,成功實現了對其他激酶(如PKCδ、DYRK1A)的選擇性抑制。
該研究的突破性還體現在工藝流程的綠色化改進。傳統磺酰胺化工藝需要無水條件及嚴格溫度控制,而本方法在室溫下即可完成,且副產物產率降低至5%以下。通過開發水相輔助反應體系,成功將溶劑消耗量減少70%,同時提高產物純度至98%以上。這種環境友好型合成路線為核苷類藥物的規模化生產提供了新思路。
在藥物開發應用層面,研究團隊構建了基于磺酰胺化修飾的藥物設計策略。通過計算機輔助藥物設計(CADD)發現,磺酰胺基團與Haspin激酶的ATP結合口袋存在獨特的氫鍵網絡:磺酰胺的N-H與口袋中的Arg殘基形成氫鍵,而磺酰基的羰基則與Ser363形成分子內氫鍵。這種雙重作用機制解釋了化合物9a活性優于sangivamycin的現象——雖然IC50值略有升高,但通過優化磺酰胺基團的取代基(如引入異丙基增強疏水作用),仍能保持接近原始化合物的抑制活性。
研究還揭示了核苷功能化中的新物理化學規律。通過對比不同取代基的電子效應,發現當磺酰胺基團的對位電子云密度(PDD)超過0.35時,能顯著增強與激酶結合口袋的相互作用。這種量化分析為理性設計核苷類化合物提供了新參數。此外,利用同位素標記技術證實,C7位取代基的立體構型(R/S)對活性影響呈劑量依賴關系,當取代基構型與激酶結合位點完全匹配時,活性可提升2-3倍。
在方法學驗證方面,研究團隊構建了嚴格的對照實驗體系。通過合成未磺酰胺化的中間體(如化合物5)和副產物(如磺酸化合物),明確排除了其他因素對活性的影響。特別在合成路徑優化階段,比較了5種不同磺酰化試劑的效率,最終確定使用碘代副產物(化合物7)作為磺酰氯源,不僅解決了傳統氯磺化試劑(如亞硫酰氯)的毒性問題,還通過原子經濟性計算(總原子數減少42%)實現了合成效率的提升。
該成果對藥物化學領域具有重要啟示。首先,建立了C7位作為新型功能化位點的技術規范,填補了該位置化學修飾的空白領域。其次,開發的高穩定性磺酰氯中間體技術,可推廣至其他生物活性分子(如多肽、小分子抑制劑)的磺酰胺化修飾。最后,通過構建包含63種激酶的活性譜數據庫,為精準靶向藥物設計提供了新工具,相關數據已開放獲取。
未來研究可沿著三個方向深入:1)探索磺酰胺基團在核苷中的構象變化及其對活性影響;2)開發模塊化合成平臺,實現從起始原料到活性化合物的全流程自動化;3)結合冷凍電鏡技術解析磺酰胺化修飾后的核苷-激酶復合物結構,為藥物設計提供更直接的分子機制證據。該研究不僅拓展了核苷化學修飾的可能性,更為靶向激酶的小分子藥物開發提供了高效的方法學平臺。
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