《Transplantation Proceedings》：Whole Transcriptome Sequencing Identified Potential Serum Protein Markers for the Diagnosis of Antibody Mediated Rejection Following Liver Transplantation
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抗體會介導的肝移植排斥（AMR）機制及血清標志物研究通過比較4例AMR患者與4例健康患者的肝組織轉錄組及血清蛋白譜，發現HLA I/II類分子顯著上調（2.53-3.13倍），補體C3/C6/C8及因子H等蛋白顯著下調（0.54-0.72倍），提示這些指標可作為AMR診斷的生物標志物。
袁毅芒|尹佳旺|王莉|陳國宇|羅波|蘇剛|吳曉和|楊倩|謝穎|冉江華|張生寧
云南省第一人民醫院肝膽外科及肝臟移植外科；昆明理工大學附屬醫院，中國云南省昆明市
摘要
背景
抗體介導的排斥反應（AMR）是接受肝臟移植患者面臨的一個具有挑戰性的問題。本研究旨在探討AMR的機制，并識別潛在的血清標志物以用于AMR的診斷。
方法
收集了4例AMR患者和4例無AMR患者的肝組織。通過全轉錄組測序（RNA-seq）比較了兩組患者之間的轉錄組變化，以及AMR發生前后的組織變化。同時使用質譜技術比較了兩組患者的血清蛋白質組變化。
結果
對AMR患者和無AMR患者的轉錄組分析顯示mRNA、lncRNA和circRNA的表達存在差異。mRNA差異分析發現CD和IL相關標志物的變化，可能涉及M1巨噬細胞、T細胞和樹突狀細胞。HLA I型和II型分子的mRNA水平變化倍數在1.57至3.13之間（P < .05），表明所有有核細胞中的HLA表達增加。相比之下，lncRNA和circRNA相關基因的顯著變化表明T細胞、B細胞、NK細胞、DCs和單核細胞的表達發生了全面上調或下調。AMR患者和無AMR患者的血清蛋白質分析顯示補體C3（變化倍數：0.63，P = .028）、C6（變化倍數：0.72，P = .05）、C8（變化倍數：0.67，P = .020）、因子H（變化倍數：0.54，P = .007）和C4結合蛋白（變化倍數：0.70，P = .025）的表達顯著下調，而HLA I類分子（變化倍數：2.53，P = .006）和低親和力IgGamma（變化倍數：1.74，P = .024）的表達顯著上調，這些可能是AMR的潛在血清標志物。進一步的轉錄組分析表明，經過治療后康復的AMR患者體內免疫細胞水平、HLA抗原水平和細胞因子表達發生了全面且非特異性的變化，表明即使AMR得到治愈，免疫系統仍存在變化。
結論
AMR導致移植肝臟的細胞微環境發生廣泛變化，包括細胞組成、抗原表達和細胞因子表達。已鑒定出一組與AMR相關的血清蛋白質標志物，這些標志物可能可用于AMR的診斷。
章節片段
倫理
本研究由昆明醫科大學Calmette附屬醫院肝膽胰腺外科及肝臟移植中心、云南省第一人民醫院器官移植臨床醫療中心設計和實施。該研究獲得了醫院倫理委員會的批準，并遵循相關指導原則（YLS2020-141）進行。已從患者處獲得書面知情同意。
AMR患者與非AMR患者的轉錄組分析揭示了AMR的可能機制
首先研究了AMR患者（R組）和無AMR患者（CK組）之間的mRNA差異表達。圖1顯示了熱圖、火山圖和富集分析結果。熱圖（圖1A）中可見R組和CK組之間存在顯著差異。火山圖（圖1B）進一步證實了許多顯著上調（紅色點）或下調（綠色點）的基因。隨后的富集分析發現了許多差異表達的基因
討論
免疫排斥主要通過兩種方式發生。T細胞在移植排斥中起著重要作用，細胞介導的排斥機制主要是T淋巴細胞被激活以識別并攻擊異體器官的組織細胞。T淋巴細胞分泌多種細胞因子，如干擾素-γ（γ-IFN）和腫瘤壞死因子（TNF-α），這些因子不僅會引發免疫反應，還會導致血管內皮細胞損傷、凝血和聚集
倫理批準和參與同意
本研究獲得了云南省第一人民醫院倫理委員會的批準，并遵循醫院的指導原則進行。
數據和材料的可用性
本研究生成和/或分析的數據集可根據合理請求向相應作者索取。作者貢獻
所有作者共同設計了本研究，并負責項目的管理和實施，包括數據下載與分析、患者招募、樣本收集、樣本儲存與運輸以及測序實驗。所有作者負責數據收集、初步數據分析、最終統計分析以及圖表的制作。所有作者共同撰寫并校對了手稿。
利益沖突聲明
作者聲明本研究在沒有任何可能被視為利益沖突的商業或財務關系的情況下進行。
