猴痘病毒的超高靈敏度檢測:利用CRISPR驅動的信號放大技術與DNA四面體介導的傳感界面實現協同作用
《Biosensors and Bioelectronics》:Ultrasensitive detection of monkeypox virus: harnessing synergistic CRISPR-driven signal amplification on a DNA tetrahedron-mediated sensing interface
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時間:2026年01月25日
來源:Biosensors and Bioelectronics 10.7
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猴痘病毒快速檢測新方法:CRISPR/Cas12a結合四棱錐DNA納米結構實現高靈敏度電化學傳感,集成智能手機便攜設備可現場診斷。
杜天辰|丁峰|馬曉欣|羅毅|朱丹|王連輝|蘇紹
南京郵電大學先進材料研究所(IAM)柔性電子國家重點實驗室(LoFE)與江蘇智能生物材料與診療技術重點實驗室,中國南京文源路9號,210023
摘要
快速、超高靈敏度地檢測新出現的傳染病對公共衛生安全至關重要。本文開發了一種電化學生物傳感器,通過結合CRISPR/Cas12a驅動的信號放大策略和基于四面體DNA納米結構(TDN)的傳感界面,實現了對猴痘病毒(MPXV)的超靈敏檢測。添加的MPXV DNA能夠有效激活Cas12a蛋白的切割活性,從而在TDN傳感界面上介導CRISPR驅動的雜交鏈反應(HCR)。辣根過氧化物酶(HRP)標記的HCR產物可以催化3,3′,5,5′-四甲基聯苯胺(TMB)和過氧化氫(H2O2)的反應,生成放大的電化學信號。基于這種信號變化,該CRISPR驅動的電化學生物傳感器表現出與預放大CRISPR基生物傳感器相當的檢測性能,包括寬線性范圍、超低檢測限、對非目標病毒(CPXV、ETCV、VZV、HSV)的優異選擇性、高重復性和良好的穩定性。通過與智能手機便攜設備的集成,該設計的即時檢測(POCT)電化學生物傳感器能夠在10%的人唾液中準確檢測出MPXV。這項工作為快速、準確和現場檢測傳染病提供了一個有前景的傳感平臺。
引言
猴痘病毒(MPXV)于1958年首次從猴子體內分離出來,屬于痘病毒科(Huang等人,2024年;Jeyaraman等人,2022年;Wang等人,2023年)。MPXV可感染人類,其特征性癥狀包括發熱、肌肉疼痛和斑丘疹(Li等人,2022年;York,2022年)。截至2024年9月,全球已有超過122個國家報告了10萬例MPXV感染病例和200例死亡病例。這一情況引起了全球的關注,特別是在世界衛生組織(WHO)于2022年7月確認缺乏有效治療方法之后(Li等人,2025年)。目前,聚合酶鏈反應(PCR)是MPXV診斷的金標準,因其具有高準確性和靈敏度(Ladnyj等人,1972年;WHO,2024年)。然而,PCR需要實驗室基礎設施、專業人員和昂貴設備,這限制了其在資源匱乏地區的應用(Li等人,2010年;Maksyutov等人,2016年)。更重要的是,大多數MPXV病例發生在資源有限的地區,因此迫切需要快速、靈敏和便攜的即時檢測(POCT)技術。
電化學生物傳感器作為一種理想的POCT傳感平臺,因其在操作簡便性、分析速度快、成本低、靈敏度高、微型化和設備集成方面的優勢而受到關注(Stefano等人,2023年)。與便攜設備結合使用時,電化學生物傳感器已被廣泛用于傳染病診斷(Wu等人,2023年)。例如,Alafeef等人開發了一種基于紙的電化學芯片,用于低成本、靈敏且特異性地檢測嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒-2(SARS-CoV-2)的核衣殼磷酸蛋白(N基因)。該設計的傳感芯片與簡單的手持讀取器結合使用,可在5分鐘內檢測到低至6.9拷貝/μL的N基因,無需任何擴增。此外,該芯片在區分COVID-19陽性樣本和陰性樣本時達到了100%的準確率(Alafeef等人,2020年)。
自從Zhang等人引入CRISPR/Cas系統用于構建寨卡病毒檢測生物傳感器以來,基于CRISPR的生物傳感器與不同方法結合使用,已被廣泛用于檢測核酸、蛋白質、細菌、病毒等(Feng等人,2025年;Gootenberg等人,2018年;Xu等人,2025年)。通常,許多基于CRISPR的生物傳感器采用預放大步驟(如PCR、環介導等溫擴增和重組酶聚合酶擴增)來提高檢測性能。然而,這些預放大步驟通常會引入關鍵限制,包括增加污染風險、延長檢測時間和需要專業設備(Xu等人,2025年;Zhou等人,2023年)。為了解決這個問題,信號放大策略已被引入到基于CRISPR的生物傳感器的構建中(Liu等人,2022年;Najjar等人,2022年;Xu等人,2023年)。作為一種無需酶的信號放大技術,雜交鏈反應(HCR)提供了一個有前景的候選方法,可以在不復雜操作的情況下放大檢測信號,實現目標分子的優異檢測性能(Lv等人,2025年;Xiao等人,2025年;Zhang等人,2024年)。我們知道,傳統的線性單鏈DNA(ssDNA)傳感界面通常由于空間阻礙而限制了探針的訪問性,大大限制了CRISPR切割效率和HCR放大動力學(Li等人,2020年)。為了解決這一界面挑戰,使用了具有精確尺寸和納米結構的三維剛性四面體DNA納米結構(TDN)支架來構建高性能傳感界面(Li等人,2023年)。精確的納米結構可以有效地調節探針DNA在傳感界面上的空間定位,顯著提高探針的訪問性和CRISPR/Cas系統的切割效率(Su等人,2021年)。
受上述進展的啟發,設計了一種用于MPXV DNA檢測的電化學生物傳感器,結合了CRISPR/Cas系統的優勢、TDN介導的傳感界面和HCR信號放大。添加的MPXV DNA能夠有效激活Cas12a蛋白的切割活性,從而調控HCR反應的發生。隨后,在有無MPXV DNA的情況下都獲得了明顯的電化學信號變化。結合便攜式電化學設備和手機,所設計的CRISPR介導的電化學生物傳感器能夠實現高效、實時和現場的MPXV DNA檢測,為傳染病的POCT早期診斷提供了有前景的潛力。
材料、方法和設備
所有寡核苷酸均由Sangon Biotech Co., Ltd.(中國上海)合成(表S1)。試劑和設備詳見支持信息。
四面體DNA納米結構(TDN)探針的組裝
簡要來說,四種單鏈DNA(S1-S4)與5 μL 50 mM TCEP孵育30分鐘以減少二硫鍵。然后,在95°C下變性10分鐘,并在4°C下快速退火形成TDN探針。純化的TDN探針儲存在冰箱中。
電化學生物傳感器的構建
具有分層花狀金納米結構的...
該生物傳感器檢測MPXV的原理
如圖1所示,設計了一種POCT電化學生物傳感器,通過與商用電極、便攜式電化學工作站和帶有APP的手機結合,用于MPXV的即時檢測。首先,在SPCE表面電沉積HFGNs,以增強其比表面積和導電性,從而有效提高TDN探針的負載量和電化學信號。隨后,在...
結論
本研究開發了一種CRISPR驅動的電化學生物傳感器,用于MPXV的檢測,結合了CRISPR/Cas12a系統、TDN傳感界面和基于HCR的信號放大策略。憑借SPCE-HFGNs、CRISPR/Cas系統、TDN傳感界面和HCR信號放大策略的優勢,所設計的生物傳感器顯示出寬動態范圍、低檢測限、快速檢測速度、高重復性和優異的存儲穩定性。
CRediT作者貢獻聲明
王連輝:監督、資源管理、項目管理和資金獲取。朱丹:撰寫——審稿與編輯、項目管理和概念構思。丁峰:方法學、數據分析、數據管理。杜天辰:撰寫——初稿、實驗研究、數據分析、概念構思。羅毅:撰寫——初稿、數據可視化。馬曉欣:實驗研究、數據分析。蘇紹:撰寫——審稿與編輯、監督、項目管理和資金獲取。
利益沖突聲明
作者聲明他們沒有已知的競爭性財務利益或個人關系可能影響本文報告的工作。
利益沖突聲明
作者聲明他們沒有已知的競爭性財務利益或個人關系可能影響本文報告的工作。
致謝
本工作得到了國家自然科學基金(62235008和62288102)、江蘇省基礎研究計劃(BK20253006和BK20243057)、江蘇省“一帶一路”創新合作項目(BZ2022011)、江蘇省高等學校自然科學基金(22KJA150003)、江蘇省研究生研究與實踐創新計劃(KYCX25_1212)以及傳感器技術國家重點實驗室項目(SKT2306)的支持。
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