《Emerging Microbes & Infections》:Involvement of the African swine fever virus protein pH108R in virion morphogenesis
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本文揭示非洲豬瘟病毒(ASFV)內膜蛋白pH108R是其粒子形態發生的關鍵調控因子。研究表明,缺失pH108R會抑制病毒基因組早期復制,并干擾晚期感染中病毒核心殼多蛋白pp220/pp62的蛋白酶解加工,導致大量異常管狀和雙葉狀結構形成。進一步發現pH108R與衣殼蛋白p49和p72相互作用,并穩定核樣蛋白pA104R的表達。體內實驗證實,敲除pH108R可顯著降低病毒對豬的致病力。該研究為理解ASFV的組裝機制提供了新視角,并為減毒疫苗開發指出了潛在靶點。
非洲豬瘟病毒(ASFV)是導致非洲豬瘟(ASF)的病原體,該病是家豬和野豬的一種高度傳染性和破壞性的出血性病毒性疾病,對全球養豬業構成嚴重威脅。目前尚無有效的疫苗或治療方法。ASFV的形態發生過程極其復雜且機制尚未完全闡明。本文聚焦于ASFV的內膜蛋白pH108R,探討其在病毒粒子形態發生中的作用。
ASFV蛋白pH108R在感染晚期表達,是一種跨膜蛋白
ASFV蛋白pH108R之前被鑒定為一種病毒內膜蛋白,在病毒復制周期晚期表達。其氨基酸序列在不同ASFV毒株間高度保守,含有一個假定的跨膜結構域。通過免疫熒光和蛋白質印跡實驗證實,在感染ASFV GS株的豬肺泡巨噬細胞(PAMs)中,pH108R信號主要位于核周的病毒工廠區域,與病毒內膜蛋白p54共定位。其轉錄和蛋白表達動力學分析顯示,H108R基因與B646L基因表現出相似的轉錄動力學,且其蛋白(約12-kDa)在感染后12小時可被檢測到,晚于衣殼蛋白p72的表達。進一步的膜拓撲學分析表明,與跨膜病毒蛋白pE248R類似,pH108R主要存在于膜組分中,并且能夠耐受堿性碳酸鹽處理,在Triton X-114誘導的溫度相分離中主要分配在去垢劑相中。這些結果綜合表明,ASFV蛋白pH108R是一種跨膜蛋白,在感染晚期表達并定位于病毒組裝位點。
缺失pH108R會抑制ASFV在體外的病毒生長
為了研究pH108R蛋白在ASFV復制中的作用,研究人員利用同源重組技術,構建了缺失H108R基因的重組病毒ASFV-GS-ΔH108R,該病毒在p72啟動子控制下表達綠色熒光蛋白(EGFP)作為報告基因。經過多輪純化與鑒定,證實pH108R表達在野生型病毒感染的細胞中被檢測到,而在重組病毒感染的細胞中幾乎無法檢測。生長曲線實驗顯示,無論在一步還是多步生長曲線中,與親本病毒ASFV-GS相比,缺失pH108R都會導致病毒產量降低超過1個對數值。這表明H108R的缺失顯著抑制了ASFV-GS在體外的復制能力。
蛋白pH108R參與病毒的形態發生
接下來,研究團隊通過透射電子顯微鏡(EM)觀察了pH108R缺失對病毒形態發生的影響。在感染親本病毒ASFV-GS 18和36小時后,病毒工廠內可檢測到前體病毒膜以及未成熟和成熟的病毒粒子。然而,在缺失pH108R表達的細胞中,組裝位點出現了大量異常的管狀結構和雙葉狀結構,而成熟粒子的數量則顯著減少。定量分析顯示,在pH108R缺失的情況下,病毒工廠中異常管狀結構和雙葉狀結構的比例大幅增加,而成熟病毒粒子的比例則急劇下降。即使在感染36小時后,這種現象依然存在,并且成熟粒子比例低于27%。同時,與親本病毒相比,ASFV-GS-ΔH108R的病毒滴度在18和36小時均下降了約1.5至1.8個對數值。將異常粒子的比例歸一化到病毒滴度后,發現缺失pH108R條件下產生的異常顆粒比例分別是存在pH108R條件下的13倍(18小時)和50倍(36小時)。這些結果表明,蛋白pH108R參與了病毒的形態發生過程。
缺失pH108R會抑制病毒感染早期的基因組復制以及感染晚期核心殼多蛋白的蛋白酶解加工和核樣蛋白pA104R的表達
為了探究缺失pH108R影響病毒形態發生的機制,研究人員檢測了位于病毒五個結構域的主要結構蛋白的表達水平。結果表明,在感染早期(18小時),pH108R的缺失顯著降低了衣殼蛋白(p72和p49)、內膜蛋白(p54和pE248R)、核心殼蛋白(pp220、pp62和pS273R)以及核樣蛋白(p10和pA104R)的水平,而早期表達蛋白p30的表達則未受到顯著影響。病毒基因組復制分析顯示,H108R缺失在感染后12、18和24小時顯著降低了病毒的基因組復制。這表明pH108R的缺失可能在感染早期通過抑制病毒基因組復制,進而抑制了晚期蛋白的表達,從而損害病毒形態發生。
有趣的是,在感染晚期(36和48小時),衣殼蛋白、內膜蛋白、核心殼蛋白酶pS273R和核樣蛋白p10在缺失pH108R情況下的表達水平與存在pH108R時相似。然而,核心殼多蛋白pp220和pp62的蛋白酶解加工在缺失pH108R表達時受到損害,且這一現象并非由于病毒蛋白酶pS273R的減少所導致。此外,核樣蛋白pA104R在缺失pH108R時的表達水平也持續低于存在pH108R時。總之,這些發現表明,pH108R缺失在感染早期抑制病毒基因組復制從而抑制晚期蛋白表達,而在感染晚期則抑制核心殼多蛋白pp220和pp62的蛋白酶解加工以及核樣蛋白pA104R的表達。
蛋白pH108R與衣殼蛋白p49和p72相互作用
由于ASFV-GS-ΔH108R病毒的表現型與之前報道的缺失p49蛋白(參與衣殼組裝過程)的ASFV重組體相似,研究人員進一步探究了衣殼蛋白是否存在于這些異常結構中。通過免疫金標記結合抗p72抗體,他們觀察到抗p72抗體標記了二十面體衣殼的最外層以及異常的管狀結構,這表明pH108R可能參與了衣殼的組裝。
鑒于缺失p49會產生類似的異常管狀結構,研究人員假設pH108R可能通過p49蛋白參與衣殼組裝。為驗證此假設,他們構建了帶有flag標簽的pH108R C末端片段和帶有myc標簽的p49 C末端片段,并通過免疫共沉淀(Co-IP)實驗證實,pH108R在HEK293T細胞和ASFV-GS感染的PAMs中均與p49蛋白存在相互作用。免疫熒光分析也顯示pH108R與p49在細胞中共定位。
有趣的是,在ASFV感染期間,p72蛋白也能與p49蛋白發生免疫共沉淀。進一步的Co-IP實驗表明,pH108R在HEK293T細胞和ASFV-GS感染的PAMs中同樣與p72蛋白存在相互作用,免疫熒光分析也證實了它們的共定位。這些發現共同證實了pH108R與衣殼蛋白p49和p72之間存在相互作用。
缺失pH108R會減弱核樣蛋白pA104R的蛋白水平
另一個值得關注的現象是,pH108R的缺失抑制了核樣蛋白pA104R的表達。為探究其機制,研究人員首先評估了ASFV-GS和ASFV-GS-ΔH108R感染的PAMs中pA104RmRNA的水平,結果表明pH108R缺失并未抑制pA104RmRNA的水平。隨后,在存在或缺失pH108R的條件下,通過添加蛋白質翻譯抑制劑放線菌酮(CHX)監測了pA104R的蛋白水平。結果顯示,缺失pH108R降低了pA104R的蛋白穩定性。此外,使用蛋白酶體、自噬和溶酶體抑制劑處理,均未能恢復因pH108R缺失導致的pA104R蛋白水平的降低。綜合來看,這些結果表明pH108R缺失引起的pA104R減少并非由轉錄或經典的翻譯后降解途徑造成。
缺失pA104R并不影響ASFV的形態發生和蛋白表達
鑒于pA104R已被證實參與病毒DNA復制和轉錄,研究人員探究了在感染早期觀察到的病毒晚期表達總體減少是否由pA104R水平的特異性降低引起。為此,他們構建了缺失A104R基因的重組病毒ASFV-GS-ΔA104R。病毒純化、PCR和測序分析確認了基因敲除的成功。
通過透射電鏡對PAMs在感染ASFV-GS或ASFV-GS-ΔA104R 18和36小時后的超微結構分析顯示,在野生型和敲除病毒感染的細胞中,細胞質病毒工廠的形態相似,均顯示出相似形態的病毒粒子,如前體病毒膜、未成熟和成熟粒子。此外,pA104R的缺失并不影響主要衣殼蛋白、內膜蛋白、核心殼蛋白、核樣蛋白以及早期表達蛋白p30的表達水平。同時,ASFV-GS-ΔA104R的復制能力與親本病毒相比僅略有下降。這些結果證明,pA104R的缺失并不影響ASFV的形態發生和蛋白表達。
缺失pH108R會減弱ASFV對豬的致病力
為評估缺失H108R對ASFV-GS在豬體內致病過程的影響,研究人員對家豬進行了肌肉接種實驗。結果顯示,所有接種親本病毒ASFV-GS的豬在感染后第5天體溫升高(>40℃),并出現典型的非洲豬瘟臨床癥狀,所有豬在感染后第8天內死亡。相比之下,接種ASFV-GS-ΔH108R的8頭豬中,僅3頭出現短暫發熱,隨后體溫恢復正常,所有豬在21天的觀察期內均存活。接觸對照組豬的體溫保持穩定。
病毒載量分析表明,接種ASFV-GS的豬在口、鼻、糞便拭子以及血液和主要組織(脾、肺、腎、淋巴結)中均檢測到高水平的病毒DNA拷貝數。而接種ASFV-GS-ΔH108R的豬和接觸組豬的病毒載量則維持在極低或檢測不到的水平。此外,接種ASFV-GS的豬其脾、肺、腎和頜下淋巴結(SLN)出現廣泛出血病變,而接種ASFV-GS-ΔH108R的豬則無明顯病變。組織病理學切片也顯示,接種ASFV-GS的豬出現脾臟大面積出血、淋巴細胞壞死,淋巴結出血、淋巴細胞壞死和核碎裂,肺部間質性肺炎以及腎臟腎小管上皮細胞壞死等嚴重病理變化,而這些病理現象在接種ASFV-GS-ΔH108R的豬中則較為輕微。綜上所述,這些結果證實,從ASFV毒株中敲除pH108R會顯著減弱病毒對豬的致病力。
討論
本研究發現,ASFV內膜蛋白pH108R在病毒形態發生中扮演著重要角色。缺失pH108R會導致大量管狀和雙葉狀異常結構的形成,這一表型與缺失衣殼組裝相關蛋白p49和pH240R的ASFV重組體相似。免疫金標記實驗證實這些異常結構含有衣殼蛋白p72,提示pH108R參與了衣殼組裝。進一步的互作研究顯示,pH108R與衣殼蛋白p49和p72均存在相互作用。鑒于p49與內膜結合的能力可能依賴于其與其他病毒膜蛋白的相互作用,pH108R與p49的互作為p49與內膜的關聯提供了證據。因此,pH108R可能通過與p49蛋白相互作用參與衣殼組裝。這一機制與其他病毒(如痘苗病毒、皰疹病毒)中通過病毒蛋白互作在病毒包膜和衣殼間建立橋梁的組裝過程類似。
此外,pH108R的缺失還抑制了核心殼多蛋白pp220和pp62的蛋白酶解加工,這可能是由于pH108R缺失阻礙了衣殼的正確組裝,進而影響了核心殼的組裝。另一方面,作為內膜蛋白,pH108R也可能直接參與內膜的形成,從而影響二十面體衣殼的組裝。
研究還發現,pH108R缺失會降低核樣蛋白pA104R的蛋白水平,但并非通過轉錄抑制或經典的蛋白酶體/溶酶體降解途徑。盡管有研究認為pA104R參與病毒晚期基因的轉錄調控且為病毒復制所必需,但本研究構建的pA104R缺失病毒并未影響ASFV的形態發生和蛋白表達,且異常結構的產生也并非由pA104R減少直接導致。因此,pH108R缺失可能通過影響病毒粒子對核樣成分的組裝,導致pA104R滯留在細胞質中,從而降低了其蛋白穩定性。
值得注意的是,pH108R缺失在感染早期也顯著抑制了病毒基因組的復制。其機制可能是pH108R直接參與了ASFV的基因組復制和修復過程,亦或是通過與參與該過程的其他蛋白或酶相互作用來發揮作用,具體機制有待進一步研究。
總之,本研究闡明了pH108R通過多種機制促進ASFV復制:一方面,通過與衣殼蛋白p49和p72相互作用參與ASFV的形態發生過程;另一方面,可能通過某種未知機制參與ASFV的基因組復制。這些發現為深入理解ASFV的形態發生機制提供了新的見解,并為開發減毒疫苗提供了一個有吸引力的潛在靶點。