2026年2月12日，上海交通大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院陳洛南教授研究團(tuán)隊(duì)合作在國際頂級學(xué)術(shù)期刊《Cell》上作為共同通訊作者發(fā)表了題為“CLIM-TIME identifies metastatic microenvironment modulators for T cell therapy response”的論文。該研究團(tuán)隊(duì)由中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心王廣川研究員、上海交通大學(xué)數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院陳洛南教授、廣州實(shí)驗(yàn)室景乃禾研究員組成。團(tuán)隊(duì)揭示了腫瘤如何通過遺傳突變改造微環(huán)境進(jìn)而導(dǎo)致免疫治療耐藥的基本規(guī)律，建立了高維數(shù)據(jù)解卷積新算法，成功識別了可顯著提升T細(xì)胞“戰(zhàn)斗力”的靶點(diǎn)，開發(fā)了可準(zhǔn)確預(yù)測免疫治療效果的AI模型。

團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)出新型技術(shù)方法平臺CLIM-TIME，實(shí)現(xiàn)對轉(zhuǎn)移瘤的轉(zhuǎn)錄組、反卷積及免疫熒光多維度分析，首次在高通量尺度上破解了腫瘤遺傳突變與轉(zhuǎn)移瘤微環(huán)境、免疫治療效果之間的關(guān)聯(lián)密碼，為解決臨床中轉(zhuǎn)移瘤免疫治療耐藥難題提供了全新策略與技術(shù)支撐，有望推動T細(xì)胞免疫治療向更精準(zhǔn)、更有效的方向發(fā)展。

團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了兩套核心分析模型：一是在細(xì)胞分類與微環(huán)境分型方面，通過建立貝葉斯概率模型完成粗粒度細(xì)胞分類，顯著提升了反卷積分析的穩(wěn)定性與可解釋性，為理解不同驅(qū)動突變背景下的免疫生態(tài)格局提供了系統(tǒng)、精準(zhǔn)的分類圖譜；二是在免疫療效預(yù)測方面，運(yùn)用自主研發(fā)的因果推斷方法NME，構(gòu)建出可臨床轉(zhuǎn)化的免疫療效預(yù)測模型，能夠快速計(jì)算免疫療效風(fēng)險(xiǎn)評分，顯著降低臨床檢測成本與難度，為腫瘤精準(zhǔn)分層治療提供可行方案。

該研究不僅為解析轉(zhuǎn)移瘤免疫治療耐藥機(jī)制提供了全新工具，也為開發(fā)新型聯(lián)合治療策略、攻克實(shí)體瘤轉(zhuǎn)移耐藥難題開辟了新路徑。

論文鏈接：https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(25)01491-6