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        工程化外泌體遞送CRISPR/Cas9靶向編輯Asporin基因:一種骨關節炎精準治療新策略

        《Journal of Nanobiotechnology》:Engineered Cas9 exosome vesicles as a novel gene editing tool for targeted ASPN editing in osteoarthritis

        【字體: 時間:2026年02月24日 來源:Journal of Nanobiotechnology 12.6

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          本研究報道了一種創新的骨關節炎(OA)基因治療策略。該研究構建了軟骨細胞親和肽(Cap)修飾的間充質干細胞(MSCs)來源的工程化外泌體,用于遞送靶向Asporin(ASPN)基因的CRISPR/Cas9系統(Cap-Exo/ASPN-Cas9)。該平臺在體內外均實現了對OA軟骨細胞的高效靶向和ASPN基因的精準敲除,顯著抑制了鐵死亡和細胞衰老,改善了線粒體功能,并最終延緩了OA的病理進展。該工作為OA的精準基因靶向治療提供了新的思路和實驗依據。

          
        背景
        骨關節炎(OA)是一種以關節軟骨進行性退變、滑膜炎癥和軟骨下骨改變為特征的慢性退行性關節疾病,是全球范圍內致殘的主要原因之一。其病理過程涉及機械應力、炎癥介質和遺傳易感性等多種因素的復雜相互作用,可觸發包括鐵死亡、線粒體功能障礙、活性氧(ROS)過量產生、促炎細胞因子和基質降解酶過度表達以及衰老相關分泌表型(SASP)因子分泌增加在內的多種病理途徑。Asporin(ASPN)是細胞外基質(ECM)富含亮氨酸重復序列蛋白家族的成員,最初在人類軟骨組織中發現。研究表明,ASPN通過與轉化生長因子-β(TGF-β)和骨形態發生蛋白-2(BMP-2)等生長因子相互作用,形成負向調節軟骨形成、增加OA易感性的反饋環。此外,ASPN的表達水平與OA嚴重程度呈正相關,加速軟骨退變并加劇炎癥,凸顯了其作為OA治療潛在靶點的重要性。
        基因編輯技術,特別是CRISPR-Cas9,為疾病治療帶來了革命性前景。然而,其體內安全高效的遞送仍是重大挑戰。病毒載體存在免疫原性等問題,而非病毒納米載體,尤其是工程化外泌體,因其優異的生物相容性、低免疫原性和組織靶向能力而備受關注。本研究旨在開發一種軟骨細胞靶向的工程化外泌體,用于遞送靶向ASPN基因的CRISPR/Cas9系統,以實現對OA的精準基因治療。
        ASPN是OA病理進展中的關鍵生物標志物
        通過對GEO數據庫(GSE114007, GSE169077, GSE207881)的生物信息學分析,研究者篩選出OA相關的差異表達基因(DEGs)。維恩圖分析顯示,在三個數據集中共同上調的DEGs有20個,其中ASPN是OA組與正常組之間表達差異最顯著的基因,在OA軟骨中顯著上調。對不同程度OA小鼠模型的組織學分析也證實,隨著OA嚴重程度增加,關節面粗糙、軟骨侵蝕加劇,OARSI評分升高,同時ASPN的陽性表達也隨之增強。蛋白質印跡(WB)分析進一步顯示,從不同嚴重程度OA模型分離的軟骨細胞中,ASPN蛋白表達水平呈進行性上升,且與OA嚴重程度呈強正相關。這些結果共同證實了ASPN在OA發病機制中的關鍵作用,是疾病進展的潛在指標。
        軟骨細胞靶向工程化外泌體的制備與表征
        鑒于ASPN在OA中的重要作用,研究者構建了靶向ASPN基因的CRISPR-Cas9基因編輯平臺(ASPN-Cas9)。為了實現對OA軟骨細胞的靶向遞送,研究者將軟骨細胞親和肽(Cap)與溶酶體相關膜蛋白2b(Lamp2b)融合,對間充質干細胞(MSCs)來源的外泌體進行表面修飾,得到Cap-Exo。隨后,通過優化電穿孔法將ASPN-Cas9質粒裝載到Cap-Exo中,形成Cap-Exo/ASPN-Cas9復合物。
        透射電子顯微鏡(TEM)顯示,Cap-Exo/ASPN-Cas9呈直徑約80-100納米的卵圓形囊泡。WB證實其表達外泌體標志蛋白TSG101、CD63、CD81,且Cap成功修飾于表面。納米流式細胞術分析顯示其平均粒徑為79.89納米,濃度約1.32×1010particles/mL。由于Cap帶正電荷,其Zeta電位為+1.7 mV,更利于與帶負電的軟骨結合。流式細胞術定量顯示,當使用4微克質粒/孔(6孔板)時,Cap的表面修飾效率約為79.1%。使用PicoGreen熒光法測定質粒裝載效率,結果顯示ASPN-Cas9質粒裝載入外泌體的效率為9.5% ± 0.6%。細胞攝取實驗顯示,用PKH67標記的Cap-Exo/ASPN-Cas9在軟骨細胞中顯示出比未修飾外泌體顯著更高的熒光信號強度,表明其靶向攝取效率更高。體內小動物熒光成像實驗也證實,經DiR標記的Cap-Exo/ASPN-Cas9在關節內注射后,在膝關節區域的熒光強度和保留時間均顯著長于非靶向組。
        Cap-Exo/ASPN-Cas9在體外增強抗炎作用并維持軟骨細胞微環境
        為評估Cap-Exo/ASPN-Cas9的抗炎效果,研究者檢測了其對巨噬細胞極化和炎癥因子表達的影響。流式細胞術顯示,脂多糖(LPS)/干擾素-γ(IFN-γ)誘導后,M1型巨噬細胞比例顯著增加至73.24%,而Cap-Exo/ASPN-Cas9處理可將其比例降至49.36%,與Exo/ASPN-Cas9效果相當,表明敲除ASPN可有效抑制M1型巨噬細胞極化。酶聯免疫吸附試驗(ELISA)顯示,Cap-Exo/ASPN-Cas9能有效抑制軟骨細胞上清中腫瘤壞死因子-α(TNF-α)、前列腺素E2(PGE2)、白介素-18(IL-18)和亞硝酸鹽的水平。WB和免疫熒光(IF)分析進一步證實,Cap-Exo/ASPN-Cas9可顯著降低由叔丁基過氧化氫(TBHP)誘導的炎癥蛋白[誘導型一氧化氮合酶(iNOS)、環氧合酶2(COX2)、TNF-α]的高表達。
        細胞外基質(ECM)降解是OA的核心特征。WB分析表明,Cap-Exo/ASPN-Cas9處理可顯著降低ECM降解關鍵酶[解整合素樣金屬蛋白酶4(ADAMTS4)、基質金屬蛋白酶13(MMP-13)]的表達,同時恢復聚蛋白聚糖(Aggrecan)和II型膠原(Collagen-II)的水平。qPCR結果與之一致。甲苯胺藍(TB)和番紅O(SO)染色顯示,Cap-Exo/ASPN-Cas9能有效對抗TBHP誘導的ECM降解。IF分析也表明,Cap-Exo/ASPN-Cas9能顯著恢復TBHP降低的Collagen-II熒光強度,并降低TBHP升高的MMP-13熒光強度。這些結果表明Cap-Exo/ASPN-Cas9能有效抑制ECM降解,維持軟骨細胞微環境穩態。
        CRISPR-Cas9介導的ASPN敲除可能通過與Nrf2轉錄因子相互作用發揮效應
        為探究ASPN敲除的分子機制,研究者對Cap-Exo/ASPN-Cas9處理的軟骨細胞進行了轉錄組測序。與對照組相比,共鑒定出2265個DEGs,其中上調1075個,下調1190個。有趣的是,核因子E2相關因子2(NFE2L2,即Nrf2)基因是上調基因之一。分子對接分析顯示,ASPN與Nrf2可通過8個氫鍵緊密結合。免疫共沉淀(Co-IP)實驗進一步在體外證實了ASPN與Nrf2之間存在相互作用。
        WB實驗發現,在正常和OA條件下,敲低ASPN并不影響Nrf2的總蛋白表達量。然而,核質分離實驗顯示,在正常和TBHP條件下,敲低ASPN后,細胞核內Nrf2的量增加,而細胞質內Nrf2的量減少,這表明ASPN在細胞質中與Nrf2結合,減少了Nrf2進入細胞核?寡趸磻(ARE)熒光素酶報告基因檢測也證實,沉默ASPN可顯著增強ARE熒光素酶活性,即增強了Nrf2的轉錄活性。這些結果表明,ASPN通過與Nrf2結合,限制了其核轉位和轉錄活性。
        進一步的基因集富集分析(GO)、京都基因與基因組百科全書(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)表明,Cap-Exo/ASPN-Cas9處理顯著富集于與ECM組織、軟骨發育相關的通路,而與細胞衰老、鐵死亡相關的通路則顯著下調。這提示,ASPN敲除后減少Nrf2降解,可能通過抑制鐵死亡和細胞衰老來發揮其保護效應。
        Cap-Exo/ASPN-Cas9在體外抑制軟骨細胞鐵死亡并緩解細胞衰老
        鐵死亡是一種鐵依賴性的程序性細胞死亡形式。研究表明,Cap-Exo/ASPN-Cas9處理能有效降低TBHP誘導的軟骨細胞內ROS水平、Fe2+積累和脂質過氧化,其效果與鐵死亡抑制劑Ferrostatin-1(Fer-1)相當。WB分析顯示,在OA模型中,TBHP處理導致鐵死亡負調控蛋白[溶質載體家族7成員11(SLC7A11)、谷胱甘肽過氧化物酶4(GPX4)、鐵蛋白重鏈1(FTH1)]表達下降,而正調控蛋白;o酶A合成酶長鏈家族成員4(ACSL4)表達上升。Cap-Exo/ASPN-Cas9處理可顯著逆轉這些蛋白的表達變化。IF成像也證實,Cap-Exo/ASPN-Cas9能恢復TBHP降低的SLC7A11和GPX4熒光強度。
        細胞衰老是OA的另一個重要特征。WB分析顯示,TBHP處理顯著增加了衰老相關蛋白(P53、P21、P16)的表達,而Cap-Exo/ASPN-Cas9處理可顯著抑制這種誘導。qPCR結果與之吻合。衰老相關β-半乳糖苷酶(SA-β-Gal)染色顯示,TBHP處理顯著增加了SA-β-Gal陽性細胞比例,而Cap-Exo/ASPN-Cas9處理則大幅降低了該比例。這些結果表明,Cap-Exo/ASPN-Cas9能有效抑制軟骨細胞的鐵死亡和細胞衰老。
        Cap-Exo/ASPN-Cas9通過激活Nrf2/HO-1通路抑制鐵死亡從而緩解線粒體功能障礙
        Nrf2/HO-1通路是細胞抗氧化防御的核心。WB分析顯示,TBHP誘導的ROS升高顯著降低了細胞核內Nrf2(n-Nrf2)的水平,而Cap-Exo/ASPN-Cas9處理有效恢復了n-Nrf2的表達,并上調了下游抗氧化蛋白[血紅素加氧酶1(HO-1)、NAD(P)H:醌氧化還原酶1(NQO1)]。IF分析顯示Cap-Exo/ASPN-Cas9處理后Nrf2在細胞核內明顯積累。ARE熒光素酶報告基因實驗再次證實Cap-Exo/ASPN-Cas9可增強Nrf2轉錄活性。使用Nrf2特異性抑制劑ML385處理,可部分逆轉Cap-Exo/ASPN-Cas9對鐵死亡標志物GPX4和SLC7A11的調控作用,表明其效應依賴于Nrf2通路。
        線粒體功能障礙與鐵死亡密切相關。TEM觀察發現,TBHP處理導致線粒體明顯腫脹、膜結構受損,而Cap-Exo/ASPN-Cas9處理極大地緩解了這些異常。WB分析顯示,Cap-Exo/ASPN-Cas9處理可上調線粒體融合相關蛋白[視神經萎縮蛋白1(OPA1)、線粒體融合蛋白1(MFN1)、線粒體融合蛋白2(MFN2)]的表達,下調線粒體分裂相關蛋白[動力相關蛋白1(DRP1)]的表達。線粒體超氧化物指示劑MitoSox染色顯示,Cap-Exo/ASPN-Cas9可顯著降低TBHP誘導的線粒體ROS生成。MitoTracker Red染色表明Cap-Exo/ASPN-Cas9恢復了受損的線粒體活性。JC-1染色評估線粒體膜電位(ΔΨm)顯示,TBHP處理顯著降低了線粒體膜電位,而Cap-Exo/ASPN-Cas9處理可使其恢復至接近基線水平。綜上所述,ASPN敲除通過激活Nrf2/HO-1通路,抑制軟骨細胞鐵死亡,緩解線粒體功能障礙,從而減少炎癥、ECM降解和細胞衰老。
        CRISPR-Cas9介導的ASPN敲除在體內緩解小鼠骨關節炎
        為評估體內療效,研究者建立了內側半月板失穩(DMM)手術誘導的OA小鼠模型。術后每周進行關節腔內注射治療,持續四周。X射線和微型計算機斷層掃描(Micro-CT)評估顯示,DMM組關節出現明顯的骨贅形成、軟骨下骨硬化、小梁異常和關節間隙狹窄。Cap-Exo/ASPN-Cas9治療產生了最顯著的保護效果,能明顯減少骨贅、平滑關節面、增加小梁密度、擴大關節間隙,其效果接近FDA批準的OA藥物塞來昔布。
        番紅O/固綠、甲苯胺藍和蘇木精-伊紅(H&E)染色顯示,DMM組軟骨顯著磨損、厚度變薄,OARSI評分高達5.67分,滑膜炎評分也最高。Cap-Exo/ASPN-Cas9治療可顯著拮抗軟骨降解,促進軟骨厚度恢復,將OARSI評分降至1.33分,并將滑膜炎評分顯著降低。免疫組織化學(IHC)分析進一步驗證了Cap-Exo/ASPN-Cas9在OA小鼠模型中的作用。DMM手術顯著減少了Nrf2陽性區域,增加了鐵死亡標志物ACSL4、MMP-13的表達,降低了II型膠原水平,并增加了炎癥標志物iNOS和COX2的表達。Cap-Exo/ASPN-Cas9治療顯著逆轉了這些病理變化。關節軟骨組織IF染色顯示,DMM模型中GPX4熒光強度大幅降低(對照組的0.23倍),表明鐵死亡增強;Cap-Exo/ASPN-Cas9處理將GPX4水平恢復至約對照組的0.79倍。同時,Cap-Exo/ASPN-Cas9還能顯著降低滑膜中CD68(巨噬細胞標志物)的表達,并減少軟骨中DRP1的表達,表明其在體內也能緩解線粒體功能障礙。此外,衰老標志物P16的表達在DMM組顯著升高(2.19倍),而Cap-Exo/ASPN-Cas9干預顯著降低了P16表達水平,緩解了軟骨細胞衰老。主要器官的組織病理學檢查未發現Cap-Exo/ASPN-Cas9給藥引起的可檢測到的全身毒性。
        討論
        本研究發現ASPN是連接氧化還原失衡、鐵死亡、線粒體功能障礙和軟骨細胞衰老的關鍵上游調節因子。機制上,ASPN直接與細胞質中的Nrf2相互作用,限制其核轉位和轉錄活性,從而抑制Nrf2介導的抗氧化信號,使軟骨細胞更容易受到氧化應激的損害。ASPN敲除顯著減少了ASPN-Nrf2結合,恢復了Nrf2核積累,增強了抗氧化反應。Nrf2活性抑制的下游后果之一是促進了鐵死亡。本研究中,通過Cap-Exo/ASPN-Cas9敲除ASPN,可顯著減輕脂質過氧化和鐵過載,通過重新激活Nrf2/HO-1抗氧化軸來抑制鐵死亡。線粒體功能障礙是氧化應激和鐵死亡之間的關鍵交匯點。Cap-Exo/ASPN-Cas9治療可 substantially 恢復線粒體完整性,并重新平衡線粒體動力學。持續的氧化應激、鐵死亡和線粒體功能障礙共同驅動軟骨細胞衰老。Cap-Exo/ASPN-Cas9治療顯著減少了SA-β-Gal陽性細胞,并下調了p16和p21的表達。這些抗衰老效應與鐵死亡應激減少和線粒體功能恢復相吻合。
        本研究也存在一些局限性。首先,外泌體遞送策略的裝載效率和穩定性仍需進一步優化。其次,盡管外泌體提高了遞送特異性,但軟骨穿透有限、滑膜清除、在深層軟骨區保留不足等挑戰仍未解決。未來的工程策略可能需要同時實現組織和細胞特異性靶向。再者,ASPN與Nrf2相互作用的具體分子機制尚未完全闡明,需要未來在機制研究中進一步驗證。最后,雖然體內外實驗證實了Cap-Exo/ASPN-Cas9的短期安全性和生物相容性,但仍需更全面的評估。
        結論
        本研究表明,Cap-Exo/ASPN-Cas9在體內外對OA均具有顯著的保護作用。ASPN敲除有效減少了Nrf2降解,激活了Nrf2/HO-1通路,并抑制了軟骨細胞的鐵死亡。此外,Cap-Exo/ASPN-Cas9治療緩解了線粒體功能障礙,減輕了炎癥,維持了軟骨細胞微環境穩態,減少了細胞衰老,從而延緩了OA進展。因此,靶向CRISPR-Cas9介導的ASPN缺失代表了一種新穎且有前景的OA治療方法,為未來的治療策略奠定了基礎。
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