《Plant Growth Regulation》:Multiple-environmental dissecting the genetic architecture of 1000-seed weight in a doubled haploid population derived from rapeseed cultivar ‘Dadi199’
編輯推薦:
為解析甘藍型油菜雜交種‘大地199’高千粒重的遺傳基礎,研究人員通過構建包含280個系的雙單倍體群體,在四種環境下對千粒重進行數量性狀位點(QTL)定位,鑒定出6個穩定主效QTL,驗證了其聚合多個優異等位基因,為油菜產量遺傳改良提供了重要參考。
作為中國最主要的油料作物之一,油菜的生產對于保障食用植物油供給和糧食安全具有重要戰略意義。然而,受氣候變化和人口增長壓力的雙重危機影響,近年來油菜種植面積呈現顯著下降趨勢,并且盡管有集約化耕作和分子育種的努力,其產量仍然相對較低。提高單位面積產量、選育高產品種是提升油菜總產的關鍵。油菜產量由單株角果數、每角果粒數和種子重量(通常以千粒重1表示)三個主要因素構成。其中,千粒重是決定產量的關鍵因素,它影響著種子的含油量和蛋白質含量,且大粒種子能為幼苗萌發提供更多養分,增強環境適應性,在機械化收獲中也更具優勢。因此,闡明千粒重的遺傳機制、挖掘相關有利等位基因,是油菜分子設計育種的重要目標。
在這一背景下,一個名為‘大地199’的高產高油雜交油菜品種走進了研究人員的視野。它是中國種植最廣泛的栽培品種之一,在國家區域試驗中產量表現優異。有趣的是,雖然‘大地199’的單株角果數和每角果粒數并不總是最優,但其千粒重卻顯著高于其他主要栽培品種。是什么遺傳“密碼”賦予了‘大地199’如此突出的種子重量?這個問題的答案,對于聚合優異等位基因、定向培育更高產油菜品種具有重要的理論和實踐價值。為了解答這個問題,一個由中國農業科學院油料作物研究所(武漢)主導的研究團隊,深入探究了‘大地199’及其衍生的雙單倍體群體的千粒重遺傳基礎,相關研究成果已發表在植物科學領域期刊《Plant Growth Regulation》上。
本研究主要采用了多種關鍵技術方法,包括群體構建與多環境表型鑒定、高密度遺傳圖譜構建與QTL定位,以及分子標記驗證。研究人員首先利用‘大地199’的親本‘中雙11’(ZS11)和‘R11’雜交后通過小孢子培養,構建了包含280個系的雙單倍體群體。然后,在連續三年、四個不同環境中(武漢2015、2016、2017和2017黃岡)對該群體的千粒重進行了系統的表型鑒定。為了定位控制千粒重的基因,研究團隊對群體和親本進行了全基因組重測序,利用獲得的超過112萬個單核苷酸多態性標記,構建了一張高密度的遺傳連鎖圖譜。在此基礎上,采用復合區間作圖法在不同環境下進行數量性狀位點定位。此外,為了驗證‘大地199’中已知的千粒重QTL優異等位基因,研究人員從已發表文獻中檢索了位于A3-1、A8、A9、A7a和A7b等位點上的特異性簡單重復序列標記引物,對親本、‘大地199’以及具有極端種子大小的種質材料進行了聚丙烯酰胺凝膠電泳分析。
研究結果
高產雜交種‘大地199’具有高千粒重
研究人員首先評估了‘大地199’及其親本的千粒重表現。結果表明,‘大地199’的千粒重(5.10克)顯著高于其親本‘中雙11’(4.57克)和‘R11’(4.86克)。在國家區域試驗中,盡管‘大地199’在單株角果數和每角果粒數上優勢不顯著,但其千粒重持續保持最高水平。例如,在2014-2015年和2015-2016年長江下游國家區域試驗中,其千粒重分別為4.87克和4.40克,在所有參試品種中排名第一。對2014年中國20個主要油菜雜交品種的千粒重數據分析也顯示,‘大地199’以4.51克位列第一。這說明千粒重是其獲得產量優勢的關鍵因素。
在ZRDH群體中定位千粒重QTL
為解析‘大地199’高千粒重的遺傳基礎,研究人員在四個不同環境中測定了由其衍生的ZRDH雙單倍體群體的千粒重表型。結果顯示,群體千粒重在約3克到7克之間呈正態分布。通過對該群體進行QTL分析,共檢測到15個與千粒重相關的QTL,其中11個位于A基因組,4個位于C基因組。其中,有6個QTL在多個環境中被重復檢測到,且表型貢獻率均超過10%,被確定為主效QTL。這6個主效QTL分別是:位于A07染色體上的qTSWA7-1和qTSWA7-3,以及位于A09染色體上的qTSWA9-1、qTSWA9-2、qTSWA9-3和qTSWA9-4。其中,qTSWA7-1和qTSWA7-3的有利等位基因來自母本‘中雙11’,而A09染色體上4個QTL的有利等位基因均來自父本‘R11’。這6個主效QTL共同解釋了千粒重約55%的遺傳變異。
‘大地199’中主要千粒重QTL分析
為了驗證‘大地199’是否聚合了先前報道的與千粒重相關的優異等位基因,研究人員利用文獻中已知的、位于A3-1、A8、A9、A7a和A7b等位點的特異性SSR標記,對‘中雙11’、‘R11’、‘大地199’以及具有極端種子大小的兩個種質材料(1231: 小粒,TSW < 2.5克;34?1: 大粒,TSW > 6.5克)進行了分子標記分析。結果顯示,在A8和A7a位點上,‘大地199’與其兩個親本以及大粒種質材料共享一致的有益等位基因。在qSWA3-1和TSWA7b位點上,母本‘中雙11’攜帶對千粒重有利的等位基因,‘大地199’從‘中雙11’繼承了這兩個等位基因。在A9染色體上的BrA9GMS4944標記位點,父本‘R11’攜帶有利等位基因,而‘大地199’也保留了來自‘R11’的這一等位基因。這一結果證實了‘大地199’確實聚合了來自雙親的多個千粒重有利等位基因。
結論與討論
本研究明確了千粒重是‘大地199’獲得高產優勢的核心要素。通過對由其衍生的ZRDH雙單倍體群體進行多年多點的表型鑒定和高密度QTL定位,研究人員在A07和A09染色體上鑒定出六個穩定且效應顯著的主效QTL,這些位點共同解釋了群體中約55%的千粒重遺傳變異,為后續精細定位和基因克隆奠定了基礎。分子標記驗證進一步證實,‘大地199’成功聚合了雙親的有利等位基因:它從母本‘中雙11’繼承了A3-1和A7b位點的優異等位基因,從父本‘R11’繼承了A9位點的優異等位基因,并且在A8和A7a位點上與雙親共享優異等位基因。
這項研究的意義在于,它不僅從遺傳學角度解釋了明星品種‘大地199’高千粒重性狀的來源,揭示了“有利等位基因積累”而非單個位點超顯性是驅動該雜交種產量優勢的重要模型,還為油菜分子設計育種提供了寶貴的遺傳資源和明確的選擇靶點。研究鑒定出的主效QTL及其關聯的分子標記,可用于油菜高千粒重性狀的標記輔助選擇育種。通過將這些位于A07和A09染色體上的優異單倍型導入到其他優良但種子重量中等的品種中,有望快速提升油菜品種的千粒重和整體產量,加速下一代高產油菜品種的培育進程。