《LWT》:Development of a novel phage cocktail and its efficacy in controlling carbapenem-resistant
Klebsiella pneumoniae in the food production chain
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面對食源性致病菌污染日益嚴峻的挑戰,本研究聚焦于分離、表征并應用針對耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(CRKP)的噬菌體。研究人員成功開發了一種由LAL003和YP11噬菌體組成的雞尾酒療法,該療法具有廣譜、安全、高效的特點,能在豬肉、牛奶、生菜等多種食品基質及聚丙烯、不銹鋼等常見食品接觸表面上有效殺滅CRKP并清除其生物膜。該研究為應對CRKP沿食品生產鏈的傳播與交叉污染提供了創新的生物防控策略,具有重要的公共衛生與食品安全意義。
在當今的餐桌上,我們享受著來自全球各地的豐富食材,但伴隨美味而來的,還有潛藏的食物安全風險。其中,一類名為肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae, K. pneumoniae)的細菌,正悄然成為食品供應鏈中的不速之客。更令人擔憂的是,其中一部分細菌進化出了抵抗最強力抗生素之一——碳青霉烯類抗生素的能力,被稱為耐碳青霉烯類肺炎克雷伯菌(CRKP)。這些“超級細菌”不僅能在肉類、奶制品、蔬菜中被檢出,還能在廚房的砧板、水槽乃至食品加工設備表面形成頑固的生物膜,成為反復污染食品的“細菌堡壘”。傳統的化學消毒和熱處理手段往往難以平衡有效殺菌與保持食品品質之間的關系,有時還可能引發細菌耐藥性。因此,尋找一種既能精準打擊有害細菌,又對環境和食品本身友好的新型“生物武器”,成為了保障“舌尖上的安全”的迫切需求。近期,一項發表在食品科學領域權威期刊《LWT》上的研究,為我們帶來了一種充滿希望的解決方案:一種新型的噬菌體雞尾酒。
噬菌體(Bacteriophage),顧名思義是“吃”細菌的病毒。它們像大自然中的精準“獵手”,能夠特異性地感染并裂解特定的細菌,而對人體細胞和食物中的有益菌群“秋毫無犯”。將幾種具有不同“獵殺”能力的噬菌體混合成“雞尾酒”,可以拓寬攻擊范圍,并延緩細菌產生抗性,是當前抗菌研究的熱點。為了應對食源性CRKP的威脅,來自黑龍江八一農墾大學的研究團隊開展了一項系統研究,旨在開發一種安全、高效、適用于整個食品生產鏈的噬菌體雞尾酒防控策略。
研究人員首先從中國大慶的污水樣本中,以標準菌株K. pneumoniae ATCC 700603為宿主,分離并純化出了兩株全新的噬菌體,分別命名為LAL003和vB_KpnM-YP11(YP11)。他們隨后對這兩株噬菌體進行了全面的生物學和基因組學表征,評估了其作為生物防控劑的潛力,并最終將它們組合成雞尾酒,在模擬的真實食品生產環境中測試了其殺菌和抗生物膜效果。研究結果表明,這種噬菌體雞尾酒能有效抑制和清除食品及其接觸表面上的CRKP,為控制其沿食物鏈傳播提供了強有力的工具。
為完成這項研究,作者主要運用了以下幾項關鍵技術:1. 采用雙層瓊脂平板法從環境樣本中分離、純化噬菌體,并利用透射電子顯微鏡(TEM)觀察其形態。2. 通過斑點法和生長曲線測定,評估噬菌體的裂解譜、最佳感染復數(MOI)、一步生長曲線(包括潛伏期和裂解量)以及對不同pH、溫度、紫外線和乙醇的耐受性。3. 利用全基因組測序(基于Illumina MiSeq平臺)和生物信息學分析(如RAST、CARD、VFDB數據庫),解析噬菌體LAL003和YP11的基因組特征、分類地位,并篩查毒力因子和抗生素抗性基因。4. 通過大蠟螟(Galleria mellonella)幼蟲模型,注射高滴度噬菌體雞尾酒,評估其在體內的安全性。5. 建立食品和接觸表面污染模型,在豬肉、巴氏殺菌牛奶、生菜以及聚丙烯、不銹鋼、硼硅酸鹽玻璃、乳膠等材料表面,定量評估噬菌體雞尾酒在不同溫度(4°C和25°C)和不同MOI下對CRKP及其生物膜的殺滅與清除效果。
研究結果:
3.1. 噬菌體LAL003和YP11的形態和生物學特征:透射電鏡顯示,LAL003和YP11具有多面體衣殼和長尾,屬于Straboviridae科的Jiaodavirus屬。兩者最佳MOI分別為0.01和0.1,潛伏期均為10分鐘,裂解量分別為107和185 PFU/感染細胞。
3.2. 噬菌體LAL003和YP11的環境耐受性:兩株噬菌體在pH 3-11和4-50°C(LAL003)/60°C(YP11)范圍內保持穩定活性。它們對紫外線和乙醇(特別是75%濃度)敏感,提示在實際應用中應避免與這些消毒方式同時使用,但可考慮序貫使用。
3.3. 噬菌體及噬菌體雞尾酒的裂解活性評估:在液體培養中,相比單一噬菌體,由LAL003和YP11組成的雞尾酒能更穩定、持久地抑制浮游細菌的生長,延緩了可能出現的抗性菌株增殖。
3.4. 宿主譜和莢膜特性:宿主譜分析顯示,YP11能裂解75.76%(50/66)的測試菌株,覆蓋10種莢膜血清型;LAL003能裂解54.54%(36/66),覆蓋7種血清型。兩者均嚴格特異于肺炎克雷伯菌。基于其互補的宿主譜,將兩者制成雞尾酒后,裂解率提升至87.88%(58/66),覆蓋了測試的全部11種莢膜血清型,包括多種CRKP菌株。
3.5. 基因組特征和比較基因組學分析:LAL003和YP11的基因組均為線性雙鏈DNA,大小分別為166,210 bp和166,607 bp,GC含量約39.5%。基因組分析未檢測到毒力因子、溶原相關基因或抗生素抗性基因,證實了其遺傳安全性。系統發育分析將其歸為Jiaodavirus屬。比較基因組顯示它們與已知的廣譜噬菌體ΦKR1和ΦKR8具有高度相似性。
3.6. 基于大蠟螟模型的噬菌體雞尾酒安全性評估:向大蠟螟幼蟲注射高達1010PFU/幼蟲的噬菌體雞尾酒,48小時后所有幼蟲均存活,表明該雞尾酒在實驗劑量下無可見毒性。
3.7. 在食品基質中的功效:在4°C和25°C下,噬菌體雞尾酒在豬肉、巴氏殺菌牛奶和生菜上均能有效抑制CRKP-06菌株的生長。在MOI=10、25°C條件下效果最佳,如在豬肉上12小時減少1.81 lg CFU/mL,在牛奶中9小時減少2.18 lg CFU/mL。研究表明,該雞尾酒可用于食品加工和儲存前的快速污染控制。
3.8. 在食品生產鏈接觸表面的功效:噬菌體雞尾酒能在4小時內顯著減少涂布在聚丙烯、不銹鋼、硼硅酸鹽玻璃和乳膠表面的CRKP數量。例如,在4°C下,對聚丙烯和不銹鋼的減少量分別達到1.51和1.82 lg CFU/mL,在25°C下效果更佳。這證明其可用于食品加工設備和工作臺面的快速消毒。
3.9. 在不同材料表面生物膜上的功效:噬菌體雞尾酒表現出強大的抗生物膜活性。在MOI=10下處理12小時,能清除超過90%的已形成生物膜,對硼硅酸鹽玻璃表面的清除率高達99.41%,對聚丙烯、不銹鋼和乳膠的清除率也分別達到98.15%、99.23%和92.22%。
研究結論與意義:
本研究成功分離并表征了兩株新型、裂解性、遺傳安全的肺炎克雷伯菌噬菌體LAL003和YP11。通過理性設計,將兩者組合成噬菌體雞尾酒,實現了對包括11種不同莢膜血清型在內的多種肺炎克雷伯菌(特別是CRKP)的廣譜裂解。全面的安全性評估(基因組學分析和體內大蠟螟模型)為其在食品領域的應用奠定了基礎。最關鍵的是,研究系統性地證明了該噬菌體雞尾酒在模擬真實場景下的雙重功效:一方面,它能在豬肉、牛奶、生菜等代表性食品中有效控制CRKP污染;另一方面,它還能高效殺滅附著在聚丙烯、不銹鋼、玻璃、乳膠等常見食品接觸材料表面的CRKP浮游菌及其形成的頑固生物膜。
這項研究的創新性和重要意義在于,它不僅僅停留在實驗室的殺菌效果驗證,而是將解決方案延伸至了整個食品生產鏈的關鍵環節。它針對的正是食品加工中棘手的交叉污染問題——細菌從原材料到加工設備,再到最終產品的傳播路徑。該噬菌體雞尾酒作為一種天然的生物防控劑,具有宿主特異性高、不破壞食品品質、不易引發細菌廣泛耐藥性、環境友好等優勢。其研究成果為開發新型、高效的食品級消毒劑和防腐方案提供了直接的科學依據和技術儲備,對于阻斷CRKP等“超級細菌”從農場到餐桌的傳播鏈條,降低食源性疾病風險,保障全球食品安全和公共衛生具有重要的現實價值和應用前景。盡管其長期效果和在更復雜食品基質中的應用仍需進一步驗證,但本研究無疑為對抗日益嚴重的抗生素耐藥性及食源性病原菌污染開辟了一條充滿潛力的新途徑。