《Ecography》：Plant diversity estimates of Mediterranean islands differ among biodiversity databases
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本研究通過比較全球生物多樣性信息網絡（GBIF）、歐洲植被檔案（EVA）和全球植物區系與性狀清單（GIFT）三大數據庫，揭示了不同數據源在評估地中海島嶼維管植物多樣性時存在的系統性偏差、地理覆蓋不均及清單完整性差異。文章指出，清單數據庫（GIFT）通常能提供最全面的物種目錄，而點狀發生數據（GBIF）和植被樣地數據（EVA）雖可互為補充，但存在顯著的分類學和地理學偏差。研究結果強調了整合多源數據、彌補知識鴻溝對于精確評估這一生物多樣性熱點地區生態狀況與制定保護策略的至關重要性。
材料與方法
研究聚焦于地中海盆地的島嶼生態系統，該區域是全球生物多樣性熱點，擁有超過2200個面積大于0.01 km2的島嶼。研究團隊基于MEDIS數據庫提供的島嶼空間數據，分別從全球生物多樣性信息網絡（GBIF）、歐洲植被檔案（EVA）和全球植物區系與性狀清單（GIFT）這三個大型數據庫中，提取了與這些島嶼相關的維管植物數據。數據提取后，經過了嚴格的清洗與驗證流程，包括使用分類學名稱解析服務（TNRS）進行名稱標準化、剔除定位不準（位置不確定性>500米或缺失）的記錄、移除可能代表栽培個體的記錄，以及過濾掉海洋植物和雜交種。最終，獲得了可用于比較分析的島嶼物種名錄。此外，研究還將物種區分為本地種與外來種（新熱帶植物），并依據島嶼面積將其劃分為小型（0.01–1.00 km2）、中型（1–100 km2）和大型（> 100 km2）三類，以便于后續分析。
地理覆蓋
三大數據庫的綜合數據僅覆蓋了MEDIS數據庫中790個島嶼（占35.6%）。數據可獲得性隨著島嶼面積的增大而顯著提高，大型島嶼的數據覆蓋率達到100%，而小型島嶼僅26.8%。在30×30 km的網格尺度上，GBIF和EVA的空間覆蓋率較高，分別為52.8%和45.4%，而GIFT的覆蓋率較低，僅為21.7%。地理覆蓋呈現出明顯的區域不均衡性：法國（特別是科西嘉島）、克羅地亞、希臘愛奧尼亞群島和愛琴海群島的數據覆蓋相對較好；相比之下，北非（阿爾及利亞、突尼斯）和近東海岸的島嶼、撒丁島周圍的許多小島以及土耳其的眾多島嶼數據嚴重缺乏。
清單完整性
以旨在提供完整物種名錄的GIFT數據庫為參考基準，評估GBIF和EVA的清單完整性。結果顯示，在大部分共有的島嶼上，GIFT報告的本地和外來物種豐富度值均高于GBIF和EVA。具體而言，GIFT的本地物種豐富度范圍為5-2704種，而GBIF和EVA分別為1-2171種和2-1761種。在157個與GIFT共有的島嶼中，GIFT的物種名錄在152個島嶼（95.6%）上最為豐富。通過構建島嶼物種-面積關系（ISAR）模型進一步分析，發現GIFT模型對單位面積物種數的估計值最高（參數c = 182.2），且模型擬合度最佳（R2adj= 0.94）。相比之下，GBIF和EVA的模型則顯示出較低的c值和較高的z值，表明它們系統性地低估了物種豐富度，尤其是在小型島嶼上。此外，僅有少數島嶼在GBIF（28個）和EVA（111個）中的物種記錄達到了GIFT預期豐富度的50%以上，凸顯了前兩者在清單完整性上的不足。z, where S is the species richness, A is the island area, c and z are two parameters respectively estimating the number of species per unit area and the rate of increase of species richness with increase of island area. The power model is graphically represented here in the log–log scale.">
分類學覆蓋
對63個三大數據庫共有的島嶼進行物種等級-頻率分布分析，發現GIFT系統地報告了比GBIF和EVA更高的物種出現頻率。在排名前100的物種中，與GIFT相比，GBIF和EVA顯示出對多年生物種的正向偏差以及對一年生物種的低估。例如，GBIF明顯高估了蘭科（Orchidaceae）等“魅力物種”的出現頻率，而低估了禾本科（Poaceae）等常見但不顯眼類群的頻率。EVA的物種頻率模式與GIFT更為接近，但在特定類群上也存在偏差。這些結果表明，GBIF和EVA的數據存在明顯的分類學采樣偏差，這可能源于公民科學數據的偏好（傾向于記錄醒目物種）以及植被樣地調查的選擇性（側重于特定生境或群落類型）。
討論與未來展望
本研究首次綜合比較了代表三種不同植物多樣性數據格式的大型數據庫在地中海島嶼的應用。主要結論包括：1）盡管地中海盆地是研究較充分的地區，但仍存在巨大的知識缺口，超過60%的島嶼缺乏植物物種數據；2）GIFT作為清單數據庫，在物種名錄完整性方面最具參考價值；3）GBIF（點狀發生數據）和EVA（植被樣地數據）雖然地理覆蓋更廣，能補充GIFT未覆蓋的島嶼信息，但其數據存在顯著的分類學偏差（如偏愛多年生和魅力物種）、地理采樣偏差以及清單不完整的問題；4）不同數據庫的數據特性使其適用于不同的研究目標，例如GBIF適合物種分布建模，EVA適合群落生態學研究，而GIFT則為宏觀生態學和生物地理學分析提供了更可靠的基線。
針對這些發現，文章提出了未來展望與建議。首先，亟需通過數字化歷史資料（如地方植物志、標本館記錄）和開展有針對性的野外調查，來填補地理和數據缺口，特別是北非、近東及眾多小島的數據空白。其次，應促進GBIF、EVA和GIFT等主要數據庫之間的互操作性，整合多源數據以獲取更全面的生物多樣性信息。再者，在利用公民科學數據擴大采集范圍的同時，必須輔以專家驗證和嚴格的數據清理流程，以控制數據質量并減少系統偏差。最后，需要建立持續的監測機制和長期資助，以支持地中海區域生物多樣性數據基礎設施的維護與擴展，從而為區域生物多樣性保護、入侵物種管理和生態系統變化研究提供堅實的數據基礎。
