摘要

Dalbergia sissoo是紅木屬中的一種優(yōu)質(zhì)木材物種，但在印度次大陸的整個分布范圍內(nèi)其種群數(shù)量正在急劇下降。然而，目前對于其保護和管理所需的種群遺傳學知識卻非常匱乏。本研究旨在利用基因組測序（GSS）方法為D. sissoo開發(fā)新的簡單序列重復（SSR）標記，并對來自印度北部和中部地區(qū)的種質(zhì)資源進行鑒定。通過下一代測序（NGS）平臺，共生成了約7400萬個原始讀段，從而部分重建了359,272個基因組片段，平均片段長度為3,781 bp。通過對基因組片段的分析，共鑒定出25,596個微衛(wèi)星重復序列，其中二核苷酸重復序列最為常見，且所有重復序列類別中AT富集的基序都較為普遍。隨后為15,614個SSR位點設(shè)計了引物對，并通過聚合酶鏈反應（PCR）驗證了其中121個位點的存在。最終有82個SSR位點被成功擴增，其中14個位點表現(xiàn)出多態(tài)性。本研究顯示，所研究的D. sissoo種質(zhì)資源的遺傳多樣性（He = 0.418；Ar = 2.75）和遺傳分化程度（F_ST = 0.118）處于中等水平�；�于鄰接連接法（Neighbour-Joining）、主坐標分析（PCoA）、主成分判別分析（DAPC）和貝葉斯分析的所有聚類方法均表明，印度中部干旱地區(qū)（Bundelkhand區(qū)域）的種質(zhì)資源形成了一個獨立的遺傳群。這些基因組資源及種群層面的研究結(jié)果為未來的遺傳改良、適應性性狀發(fā)現(xiàn)和長期保護規(guī)劃奠定了基礎(chǔ)，從而增強了該物種的適應能力，確保了其在原生范圍內(nèi)的可持續(xù)利用。