《Water Research》:Macrophyte Restoration Alters Sedimentary Organic Matter-Microbes-Environment Interactions and Enhances Carbon Sequestration in Lake Sediment
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抗生素抗性基因(ARGs)在河床地下帶(HZ)塑 сферах中的分布受水力交換調(diào)控,上升流增強表面ARGs富集并促進氮循環(huán)與水平基因轉(zhuǎn)移(HGT),抑制ARG擴散;下降流和靜水條件維持底部富集。氮循環(huán)與HGT協(xié)同調(diào)控ARGs傳播,水力交換通過改變環(huán)境壓力影響微生物群落結(jié)構(gòu)及基因交換效率。
陳玉芳|嚴振華|袁琪怡|馬蘭|王敏|張鵬|姜潤仁|盧光華|袁賽宇|吉娜·尤-洪·金
中國河海大學水循環(huán)與水安全國家重點實驗室,南京210098
摘要
由于抗生素抗性基因(ARGs)對生態(tài)安全和人類健康的潛在風險,其普遍性引起了越來越多的關(guān)注。盡管塑料圈已被認為是ARG傳播的熱點區(qū)域,但關(guān)于水文交換如何重塑塑料圈中ARG的傳播機制知之甚少,而這種傳播經(jīng)常發(fā)生在具有垂直上升流和下降流的潛流帶(HZ)中。為了填補這一知識空白,本研究在不同水文交換情景下調(diào)查了HZ內(nèi)垂直分布的塑料圈中ARG的傳播情況。結(jié)果表明,水文交換降低了HZ塑料圈中ARG的豐度。從垂直角度來看,上升流將ARG富集模式向表面塑料圈轉(zhuǎn)移,而在無水交換條件下,ARG則主要集中在底部。此外,水文交換重新組裝了塑料圈中的微生物群落,上升流導致微生物物種豐富度和多樣性增加。值得注意的是,上升流的塑料圈顯著富集了硝化細菌和相關(guān)基因,這對ARG的傳播產(chǎn)生了負面影響。與表面塑料圈相比,底部塑料圈中的ARG-宿主相互作用更為復雜,而上升流減弱了這種復雜性。此外,塑料圈中ARG的豐度與移動遺傳元件(MGE)的豐度顯著正相關(guān)(Pearson’s R = 0.687-0.997,P < 0.05),表明水平基因轉(zhuǎn)移(HGT)具有很高的潛力,這主要由轉(zhuǎn)座酶和整合酶調(diào)控。總體而言,氮循環(huán)和HGT共同調(diào)節(jié)了水文交換條件下HZ塑料圈中ARG的傳播,但它們的作用相反:氮循環(huán)起抑制作用,而HGT則促進了ARG的傳播。這些發(fā)現(xiàn)為HZ塑料圈中ARG的傳播提供了新的見解,突顯了在水資源硝酸鹽污染日益嚴重的背景下水文交換對抗微生物抗性的重要作用。
引言
塑料制品在現(xiàn)代社會的各個方面都不可或缺,因此21世紀被稱為“塑料世紀”(Yan等人,2024a)。然而,低回收率和不當處理導致大量塑料廢物持續(xù)釋放到水環(huán)境中。隨著時間的推移,這些塑料被分解并破碎成直徑≤5毫米的微塑料(MPs)。微生物群落定殖在MPs上并形成微生物聚集體,這被稱為“塑料圈”(Zettler等人,2013)。值得注意的是,塑料圈已被確定為抗生素抗性基因(ARGs)的熱點區(qū)域,為生物和非生物成分之間的基因交換提供了隔離的生態(tài)位。Wu等人(2023a)報告稱,塑料圈中抗生素抗性微生物(ARB)的密度大約是周圍環(huán)境的100至5000倍,從而導致ARGs的水平基因轉(zhuǎn)移(HGT)更加頻繁。此外,作為“特洛伊效應(yīng)”的載體,MPs可以容易地吸附周圍環(huán)境中的大量污染物(Samaei等人,2025),進一步對塑料圈中的微生物群落施加選擇壓力,從而加劇了抗菌抗性(AMR)。因此,全面研究塑料圈中ARGs的存在水平和調(diào)控機制對于確定MPs和AMR在水生生態(tài)系統(tǒng)中的命運和潛在風險至關(guān)重要。
潛流帶(HZ)是河流水面水和地下水之間的關(guān)鍵生態(tài)過渡帶,在調(diào)節(jié)MPs的垂直遷移中起著重要作用(Dichgans等人,2023;Drummond等人,2022)。例如,Zhang等人(2025a)報告稱,HZ中的MPs可以通過潛流交換轉(zhuǎn)移到深層沉積物中,且MPs的豐度隨HZ沉積物深度的增加而減少。Drummond等人(2020)發(fā)現(xiàn),HZ中的潛流交換可以在短時間內(nèi)增加MPs的總體遷移時間和滯留時間。一旦進入河水,由于老化和微生物定殖導致的密度增加,MPs會因重力作用沉入表層沉積物。Yuan等人(2019)發(fā)現(xiàn),鄱陽湖表層沉積物中的MPs豐度(54–506個/千克)顯著高于表層水體(5–34個/升),表明沉積物是MPs的匯。Chen等人(2025a)報告稱,MPs濃度通常從表層水體向底層水體增加,夏季達到最大值9.77個/升,冬季為9.81個/升。此外,Zhang等人(2025C)總結(jié)了多個地區(qū)的HZ中MPs濃度:中國玉龍河流域為247–1708個/千克,中國東南部為570–14,200個/千克,法國艾因河流域為609–1070個/千克,意大利西北部為1033.3–10,600個/千克,印度喀拉拉邦為1675.59–2932.99個/千克。大多數(shù)地區(qū)的MPs濃度達到或超過1000個/千克(Yan等人,2021;Zhang等人,2025C),表明HZ環(huán)境中MPs的污染非常普遍且嚴重。此外,在潛流交換、降雨和底棲生物擾動的影響下,沉積的MPs可以通過HZ沉積物進行垂直遷移,從而調(diào)節(jié)其垂直分布(Heinze等人,2021;Xia等人,2023;Wazne等人,2025)。Ling等人(2022)報告稱,HZ的水文交換顯著改變了聚苯乙烯MPs的滯留行為和垂直分布。Niu等人(2021)發(fā)現(xiàn),秦淮河沉積物巖芯中MPs的濃度從淺層向深層逐漸增加。鑒于HZ中物理化學性質(zhì)的強烈垂直異質(zhì)性(如溶解氧、氧化還原電位和營養(yǎng)物質(zhì)),在HZ各層之間遷移的MPs會將塑料圈暴露于不同的環(huán)境中。由于AMR的擴散受到周圍環(huán)境因素的強烈控制,因此垂直分布的塑料圈中微生物群落的組裝和ARG的傳播可能會發(fā)生顯著變化。然而,HZ中ARG的垂直分布模式以及微生物群落的響應(yīng)仍很大程度上未知。
此外,HZ也被認為是底棲環(huán)境中生物地球化學轉(zhuǎn)化的熱點區(qū)域,尤其是在氮(N)循環(huán)方面(Van Der Hoven等人,2008;Zhou和Zhou,2023)。例如,Hinkle等人(2001)觀察到N轉(zhuǎn)化的強烈垂直氧化還原梯度:在較深的HZ中以硝酸鹽(NO??)為限制的反硝化作用為主,而在較淺的HZ中則同時存在硝化和反硝化作用。因此,HZ充當緩沖和凈化區(qū)域,在維持氮平衡方面起著關(guān)鍵作用,被稱為河流系統(tǒng)的“肝臟”。具體而言,HZ的特點是表層水和地下水之間的強烈垂直水交換,這種交換由地下水的補給和排放過程驅(qū)動(Wu等人,2018)。這些相互作用通過富含NO??的地下水與含氧但缺乏NO??的表層水之間的接觸形成了明顯的氧化還原梯度,從而促進了N循環(huán),并可能影響ARG的動態(tài)(Shuai等人,2017)。鑒于NO??水平是HZ中N轉(zhuǎn)化和微生物群落響應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因素,地下水中的NO??污染加劇可能會加劇這些效應(yīng)。實際上,由于農(nóng)業(yè)和工業(yè)活動的影響,HZ地下水中的NO??污染日益嚴重,全國調(diào)查顯示自21世紀初以來濃度平均增加了29%,39%的樣本超過了世界衛(wèi)生組織的標準(Xu等人,2025)。在不同的水文交換條件下,ARG的存在和微生物群落可能對HZ中不同NO??負荷下的環(huán)境壓力產(chǎn)生不同的響應(yīng),尤其是對參與N轉(zhuǎn)化的微生物群落。先前的研究表明,ARG水平與N相關(guān)因素(包括參與N轉(zhuǎn)化的微生物群落、功能基因和無機氮濃度)之間存在強烈關(guān)聯(lián)(Sun等人,2020;Wang等人,2021)。因此,HZ中高度活躍的氮循環(huán)和獨特的水文交換可能在MPs遷移到HZ不同層時對ARG的傳播起著重要作用。
在“同一健康”框架下,ARG在環(huán)境、動物和人類儲存庫之間的跨界傳播已成為一個全球性的關(guān)鍵問題。盡管人們越來越關(guān)注MPs引起的ARG傳播,但很少有研究關(guān)注HZ中水文交換引起的ARG傳播。特別是,上升流和下降流的相反流動及其不同的NO??負荷和氧化還原特性如何重塑氮循環(huán)途徑,從而調(diào)節(jié)垂直分布的塑料圈中ARG的傳播,這一點尚未闡明。鑒于與HZ水力連接的地下水常被用作飲用水和灌溉水源,闡明這些地下儲層中ARG的分布和潛在機制對于保護地下水質(zhì)量和維護“同一健康”框架下的人類健康至關(guān)重要。
為了解決這些空白,本研究調(diào)查了在不同水文交換情景下HZ中不同垂直分布的塑料圈中ARG的傳播模式和潛在機制。通過使用宏基因組測序方法,本研究的目標是:(1)探索不同水文交換條件下HZ塑料圈中ARG的垂直分布;(2)研究塑料圈中微生物群落的變化及其氮轉(zhuǎn)化的功能響應(yīng);(3)揭示水文交換條件下HZ塑料圈中ARG傳播的關(guān)鍵機制。這些發(fā)現(xiàn)為水生系統(tǒng)中ARG的動態(tài)提供了新的見解,有助于生態(tài)風險評估,并為保護 groundwater質(zhì)量和公共衛(wèi)生提供政策依據(jù)。
材料
選擇了可生物降解的聚乳酸(PLA)和不可生物降解的聚對苯二甲酸乙二醇酯(PET)作為目標MPs,這些物質(zhì)在水生生態(tài)系統(tǒng)中經(jīng)常被檢測到(Lavagnolo等人,2024;Rosenboom等人,2022)。此外,由于PLA和PET的密度高于水(PLA:1.21–1.30克/立方厘米,PET:1.30–1.40克/立方厘米),它們更有可能沉入深層水體和沉積物中,老化/生物污染可能進一步促進MPs的垂直遷移
出水水質(zhì)的變化
圖1顯示了HZ出水中N物種(NO??-N、NO??-N和NH??-N)以及溶解氧(DO)的濃度動態(tài)。在兩種上升流系統(tǒng)(PLA和PET)中,整個實驗期間NO??-N的濃度始終高于下降流系統(tǒng)(圖1A),這可能是由于上升流HZ進水中的NO??濃度較高(表S2)。相比之下,下降流中的PLA和PET中的NO??-N濃度接近于零。值得注意的是,在長距離傳輸后
結(jié)論
本研究調(diào)查了在不同水文交換條件下HZ垂直塑料圈中ARG的傳播及相關(guān)機制。水文交換降低了塑料圈中ARG的豐度,表現(xiàn)出“荷爾蒙效應(yīng)”。從垂直角度來看,上升流改變了ARG的分布模式,使ARG在表面塑料圈中富集,而下降流和無水交換條件通常使ARG主要集中在HZ塑料圈的底部。
CRediT作者貢獻聲明
陳玉芳:研究、概念化、數(shù)據(jù)分析、原始稿撰寫、數(shù)據(jù)管理、方法學、可視化以及審稿和編輯。嚴振華:資金獲取、項目管理、監(jiān)督以及審稿和編輯。袁琪怡:撰寫、審稿和編輯、數(shù)據(jù)分析以及審稿和編輯。馬蘭和王敏:方法學、驗證以及審稿和編輯。張鵬和姜潤仁:研究
CRediT作者貢獻聲明
陳玉芳:撰寫、審稿和編輯、原始稿撰寫、可視化、方法學、數(shù)據(jù)分析、概念化。嚴振華:撰寫、審稿和編輯、監(jiān)督、項目管理、資金獲取。袁琪怡:撰寫、審稿和編輯、數(shù)據(jù)分析。馬蘭:撰寫、審稿和編輯、可視化、方法學。王敏:撰寫、審稿和編輯、驗證、方法學。張鵬:研究
利益沖突聲明
作者聲明他們沒有已知的可能會影響本文工作的財務(wù)利益或個人關(guān)系。
致謝
本研究得到了國家自然科學基金(U2340221, 42377389)的資助。陳玉芳還獲得了中國留學基金委的資助(202406710145)。