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        解讀在水文交換作用影響下的弱流帶(hyporheic zone)中,垂直質體層(vertical plastosphere)中抗生素抗性基因形成的機制

        《Water Research》:Deciphering the mechanisms shaping the antibiotic resistance genes in the vertical plastisphere in hyporheic zone under hydrological exchange

        【字體: 時間:2026年03月03日 來源:Water Research 12.4

        編輯推薦:

          研究河床地下帶(HZ)中不同水文交換條件下塑生界(plastisphere)中抗生素耐藥基因(ARGs)的傳播機制。發現水文交換降低ARGs豐度,上升流導致表層富集而靜水維持底部富集,同時氮循環與水平基因轉移(HGT)分別抑制和促進ARGs傳播,揭示水力交換通過調控微生物群落和氮代謝影響ARGs擴散的生態機制。

          
        陳玉芳|嚴振華|袁琪毅|馬蘭|王敏|張鵬|姜潤仁|盧光華|袁賽宇|金卡琳娜·尤-宏
        中國河海大學水循環與水安全國家重點實驗室,南京210098

        摘要

        由于抗生素抗性基因(ARGs)對生態安全和人類健康的潛在風險,其普遍性引起了越來越多的關注。盡管塑料圈已被認為是ARG傳播的熱點區域,但人們對水文交換如何重塑塑料圈中ARG的傳播知之甚少,而這種傳播經常發生在具有垂直上升流和下降流的潛流帶(HZ)中。為了填補這一知識空白,本研究調查了在不同水文交換情景下,HZ內垂直分布的塑料圈中ARG的傳播情況。結果表明,水文交換降低了HZ塑料圈中ARG的豐度。從垂直角度來看,上升流將ARG富集模式推向了表層塑料圈,而在無水交換的情況下,ARG則主要富集在底部。此外,水文交換重新組裝了塑料圈中的微生物群落,上升流導致微生物物種豐富度和多樣性增加。值得注意的是,上升流的塑料圈顯著富集了硝化細菌和相關基因,這對ARG的傳播產生了負面影響。與表層塑料圈相比,底部塑料圈中的ARG-宿主相互作用更為復雜,而上升流減弱了這種復雜性。此外,塑料圈中ARG的豐度與可移動遺傳元件(MGE)的豐度顯著正相關(Pearson’s R = 0.687-0.997,P < 0.05),表明水平基因轉移(HGT)的潛力很高,這種轉移主要由轉座酶和整合酶調控?傮w而言,在水文交換條件下,氮循環和HGT共同調節了HZ塑料圈中ARG的傳播,但它們的作用相反:氮循環起抑制作用,而HGT促進了ARG的傳播。這些發現為HZ塑料圈中ARG的傳播提供了新的見解,強調了在水體硝酸鹽污染日益嚴重的背景下,水文交換對抗微生物耐藥性的重要作用。

        引言

        塑料制品在現代社會的各個方面都不可或缺,這使得21世紀被稱為“塑料世紀”(Yan等人,2024a)。然而,低回收率和不當處理導致大量塑料廢物不斷釋放到水環境中。隨著時間的推移,這些塑料被分解成直徑≤5毫米的微塑料(MPs)。微生物群落定殖在MPs上并形成微生物聚集體,即所謂的“塑料圈”(Zettler等人,2013)。值得注意的是,塑料圈已被確認為抗生素抗性基因(ARGs)的熱點區域,為生物和非生物群落之間的基因交換提供了隔離的生態位。Wu等人(2023a)報告稱,塑料圈中抗抗生素微生物群(ARB)的密度比周圍環境高100至5000倍,從而促進了ARG的水平基因轉移(HGT)的頻率。此外,作為“特洛伊效應”的載體,MPs可以容易地吸附周圍環境中的大量污染物(Samaei等人,2025),進一步對塑料圈中的微生物群施加選擇壓力,從而加劇了抗微生物耐藥性(AMR)。因此,全面研究塑料圈中ARG的發生水平和調控機制對于確定MPs和AMR在水生生態系統中的命運和潛在風險至關重要。
        潛流帶(HZ)是河流表層水和地下水之間的關鍵生態過渡帶,在調節MPs的垂直遷移中起著重要作用(Dichgans等人,2023;Drummond等人,2022)。例如,Zhang等人(2025a)報告稱,HZ中的MPs可以通過潛流交換轉移到深層沉積物中,且MPs的豐度隨HZ沉積物深度的增加而減少。Drummond等人(2020)發現,HZ中的潛流交換可以在短時間內增加MPs的總體遷移時間和滯留時間。一旦進入河水,由于老化和微生物定殖導致的密度增加,MPs會因重力作用沉入表層沉積物中。Yuan等人(2019)發現,鄱陽湖表層沉積物中的MPs豐度(54–506個/千克)顯著高于表層水體(5–34個/升),表明沉積物是MPs的匯。Chen等人(2025a)報告稱,MPs濃度通常從表層水體向底層水體增加,夏季達到最大值9.77個/升,冬季為9.81個/升。此外,Zhang等人(2025C)總結了多個地區的HZ中MPs濃度,中國玉龍河流域為247–1708個/千克,中國東南部為570–14,200個/千克,法國艾因河流域為609–1070個/千克,意大利西北部為1033.3–10,600個/千克,印度喀拉拉邦為1675.59–2932.99個/千克。大多數這些范圍達到或超過了1000個/千克(Yan等人,2021;Zhang等人,2025C),表明HZ環境中MPs的污染非常普遍且嚴重。此外,在潛流交換、降雨和底棲生物擾動的影響下,沉積的MPs可以通過HZ沉積物進行垂直遷移,從而調節其垂直分布(Heinze等人,2021;Xia等人,2023;Wazne等人,2025)。Ling等人(2022)報告稱,HZ的水文交換顯著改變了聚苯乙烯MPs的滯留行為和垂直分布。Niu等人(2021)發現,秦淮河沉積物巖芯中從淺層到深層的MPs濃度逐漸增加。鑒于HZ中物理化學性質的強烈垂直異質性(如溶解氧、氧化還原電位和營養物質),在HZ層間遷移的MPs將使塑料圈暴露于不同的環境中。由于AMR的擴散受到周圍環境因素的強烈控制,垂直分布的塑料圈中的微生物群落組裝和ARG傳播可能會發生顯著變化。然而,HZ中ARG的垂直分布模式以及塑料圈中微生物群落的響應仍很大程度上未知。
        此外,HZ還被認為是底棲環境中生物地球化學轉化的熱點區域,尤其是在氮(N)循環方面(Van Der Hoven等人,2008;Zhou和Zhou,2023)。例如,Hinkle等人(2001)觀察到N轉化的強烈垂直氧化還原梯度,在較深的HZ中以硝酸鹽(NO??)為限制的反硝化作用為主,而在較淺的HZ中則同時存在硝化和反硝化作用。因此,HZ作為緩沖和凈化區,在維持氮平衡中起著關鍵作用,被稱為河流系統的“肝臟”。具體來說,HZ的特點是表層水和地下水之間的強烈垂直水交換,這種交換由地下水的補給和排放過程驅動(Wu等人,2018)。這些相互作用通過富含NO??的地下水與含氧但NO??貧乏的表層水之間的接觸產生了明顯的氧化還原梯度,從而促進了N循環,并可能影響ARG的動態(Shuai等人,2017)。鑒于NO??水平是HZ中N轉化和微生物群落響應的關鍵調節因素,地下水中的NO??污染加劇可能會加劇這些效應。事實上,由于農業和工業活動的影響,HZ地下水中的NO??污染日益嚴重,全國調查顯示自21世紀初以來濃度平均增加了29%,39%的樣本超過了WHO標準(Xu等人,2025)。在不同的水文交換條件下,ARG的發生和微生物群落可能對HZ中不同的NO??負荷下的環境壓力有不同的響應,尤其是對于參與N轉化的微生物群。先前的研究表明,ARG水平與N相關因素(包括參與N轉化的微生物群、功能基因和無機氮濃度)之間存在強烈關聯(Sun等人,2020;Wang等人,2021)。因此,HZ中高度活躍的N循環和獨特的水文交換可能在MPs遷移到HZ的不同層時對ARG的傳播起著重要作用。
        在“同一健康”框架下,ARG在環境、動物和人類儲存庫之間的跨界傳播已成為一個關鍵的全球性問題。盡管人們越來越關注MPs引起的ARG傳播,但很少有研究關注HZ中水文交換引起的ARG傳播。特別是,上升流和下降流的對比效應,以及它們不同的NO??負荷和氧化還原特征如何重塑N循環路徑,從而調節垂直分布的塑料圈中的ARG傳播,目前尚未明確。鑒于與HZ水力連接的地下水常被用作飲用水和灌溉水源,闡明這些地下隔室中ARG的分布和潛在機制對于保護地下水質量和維護“同一健康”框架下的人類健康至關重要。
        為了填補這些空白,本研究調查了在不同水文交換情景下,HZ中垂直分布的不同塑料圈中ARG的傳播模式和潛在機制。通過使用宏基因組測序方法,本研究的目標是:(1)探索不同水文交換條件下HZ塑料圈中ARG的垂直分布,(2)研究塑料圈中微生物群落的變化及其氮轉化的功能響應,(3)揭示水文交換下HZ塑料圈中ARG傳播的關鍵機制。這些發現為水生系統中ARG的動態提供了新的見解,有助于生態風險評估,并為保護 groundwater質量和公共健康提供政策依據。

        材料

        選擇了可生物降解的聚乳酸(PLA)和不可生物降解的聚對苯二甲酸乙二醇酯(PET)作為目標MPs,因為它們在水生生態系統中經常被檢測到(Lavagnolo等人,2024;Rosenboom等人,2022)。此外,由于PLA和PET的密度高于水(PLA:1.21–1.30 g/cm3,PET:1.30–1.40 g/cm3),它們更有可能沉降到深層水域和沉積物中,老化/生物污染可能進一步促進MPs的垂直遷移

        出水水質變化

        圖1顯示了HZ出水中N物種(NO??-N、NO??-N和NH??-N)以及溶解氧(DO)的濃度動態。在兩種上升流系統(PLA和PET)中,整個實驗期間NO??-N的濃度始終高于下降流系統(圖1A),這可能是由于上升流HZ進水中的NO??濃度較高(表S2)。相比之下,下降流PLA和PET中的NO??-N水平接近零。值得注意的是,在長距離傳輸后

        結論

        本研究調查了在不同水文交換條件下HZ垂直塑料圈中ARG的傳播及相關機制。水文交換降低了塑料圈中ARG的豐度,表現出“ hormesis效應”。從垂直角度來看,上升流逆轉了ARG的分布模式,使ARG在表層塑料圈中富集,而下降流和無水交換條件通常使ARG在HZ塑料圈中富集在底部。

        CRediT作者貢獻聲明

        陳玉芳:研究、概念化、數據分析、原始草稿撰寫、數據管理、方法學、可視化以及審稿和編輯。嚴振華:資金獲取、項目管理、監督以及審稿和編輯。袁琪毅:撰寫、審稿和編輯、數據分析以及審稿和編輯。馬蘭和王敏:方法學、驗證以及審稿和編輯。張鵬和姜潤仁:研究

        CRediT作者貢獻聲明

        陳玉芳:撰寫、審稿和編輯、原始草稿撰寫、可視化、方法學、數據分析、概念化。嚴振華:撰寫、審稿和編輯、項目管理、資金獲取。袁琪毅:撰寫、審稿和編輯、數據分析。馬蘭:撰寫、審稿和編輯、可視化、方法學。王敏:撰寫、審稿和編輯、驗證、方法學。張鵬:研究

        利益沖突聲明

        作者聲明他們沒有已知的可能會影響本文工作的財務利益或個人關系。

        致謝

        本研究得到了國家自然科學基金(U2340221, 42377389)的資助。陳玉芳還獲得了中國獎學金委員會(202406710145)的支持。
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