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        2014創新產品:環狀RNA的檢測芯片

        【字體: 時間:2015年02月03日 來源:生物通

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          環狀RNA(circRNA)是RNA領域的最新研究熱點。研究表明,這種非編碼的RNA分子具有臨床診斷標志物的潛力。Arraystar公司全球首推第一款商業化circRNA芯片。它利用特異性剪接位點探針技術,能準確檢測不同生理及病理條件下circRNA的表達變化,幫助研究者對這種最新穎的ncRNA分子進行系統研究。

        過去6年,生物通一直在追蹤生命科學領域最前沿的創新產品,將其介紹給大家。2014年,生物通繼續搜羅新上市的產品,為大家奉上一場技術盛宴。經過一個半月的網頁和微信投票以及專家評鑒,2014生命科學十大創新產品終于出爐。

        環狀RNA(circRNA)是RNA領域的最新研究熱點。研究表明,這種非編碼的RNA分子具有臨床診斷標志物的潛力。Arraystar公司全球首推第一款商業化circRNA芯片。它利用特異性剪接位點探針技術,能準確檢測不同生理及病理條件下circRNA的表達變化,幫助研究者對這種最新穎的ncRNA分子進行系統研究。

        基于此,這款circRNA芯片被生物通讀者評為2014年生命科學十大創新產品之一。為了讓讀者更好地了解它,我們采訪了Arraystar中國區唯一代理服務商 – 康成生物的技術人員。

        Q:circRNA芯片通過什么原理來檢測circRNA的表達變化,適合應用在哪些方面?

        A:circRNA是目前生命科學領域新興的研究熱點分子之一。與傳統的線型RNA(linear RNA,含5’和3’末端)不同,circRNA分子呈獨特的閉合環狀結構,不受核酸外切酶影響,表達更穩定,不易降解。circRNA由特殊的選擇性剪切產生,大量存在于真核細胞的細胞質中,具有一定的組織、時序和疾病特異性。這些特征都表明circRNA有巨大潛力成為新型的臨床診斷標志物(biomarker)。在功能上,近期的研究表明,circRNA可以通過吸附microRNA抑制后者對相應靶基因的調控,從而對疾病的調控起著非常重要的功能。Arraystar circRNA芯片采用了針對circRNA特異的剪切位點而設計的探針,準確而可靠的檢測樣本中circRNA的表達情況,幫助研究者對疾病特異性的circRNA進行研究。研究者只需提供樣本,康成生物利用Arraystar circRNA芯片對樣本中特異表達的circRNA進行篩選,并提供相應的數據分析服務。

        剪接點特異性的探針:能準確可靠的檢測circRNA,即便在相應線型RNA存在的情況下也能特異性檢測circRNA。

        *圖釋:Arraystar circRNA芯片采用了針對特異性剪接點的探針。 線型RNA經過不同的方式拼接:外顯子A 的5’端和外顯子B的3’端連接,形成環狀RNA。Arraystar以circRNA特異性拼接位點作為靶標序列,設計芯片探針,即使在相應的線性RNA存在的情況下也可以準確的檢測circRNA。

        Q:目前是否有國內的客戶使用了circRNA芯片,是否有成果發表?

        A:circRNA芯片屬于Arraystar公司最新產品,康成生物是Arraystar中國區唯一代理服務商。康成生物在推出不到半年時間內,國內已經有很多老師選擇了康成生物的circRNA技術服務平臺開展針對各種疾病的circRNA篩選,通常SCI文章發表至少需要1-2年,相信到時將有高水平的研究成果會陸續發表。

        Q:康成生物目前還提供哪些非編碼RNA的分析工具?

        A:康成生物工程有限公司(簡稱“康成生物”)自2002年起專注于高通量篩選實驗服務,是國內最早一批專業提供生命科學前沿研究技術服務的高科技企業。康成生物以lncRNA、microRNA、表觀遺傳學相關檢測技術作為核心研發方向,在非編碼RNA(ncRNA)研究領域,康成生物與丹麥Exiqon、美國Arraystar等國際知名芯片品牌合作,幫助老師們開展microRNA、lncRNA相關領域研究。除了 circRNA芯片技術服務外,康成生物目前還提供ncRNA的分析工具有: microRNA芯片、piRNA芯片、miRStar™ 癌癥特異性microRNA PCR芯片、Exiqon microRNA PCR芯片、lncRNA芯片、LncPath™芯片、T-UCR芯片等。

        2006年,康成生物首選與Exiqon公司合作,開始推出microRNA芯片技術服務,是Exiqon中國區獨家代理商。Exiqon公司基于LNA(鎖核酸)專利技術開發出的microRNA研究系列技術平臺,在microRNA研究領域贏得了良好的聲譽和權威性的地位。截止到2014年,康成客戶采用Exiqon miRNA芯片及miRNA PCR芯片已發表大量SCI文章,平均影響因子大于5.5分的已超過70篇。

        2009年,隨著ncRNA研究進展的深入,一類新重要的非編碼RNA分子 – lncRNA掀起科學界的熱點話題,康成生物很快推出相應的技術服務平臺,率先開展lncRNA表達篩查服務。康成選擇的是來自美國Arraystar公司的lncRNA系列芯片,是Arraystar中國區唯一代理商。Arraystar LncRNA芯片,基于最全面的數據庫和經典文獻設計,有最合理的探針設計和最全面的lncRNA分類,是lncRNA研究領域的先驅和領導者。2013年,隨著lncRNA研究的進展,Arraystar全新推出了LncPath™這一疾病/信號通路特異性的lncRNA芯片可以快速的將lncRNA的調控機制與其在特定的信號通路或疾病中的生物學功能聯系起來,大大加快lncRNA功能的研究進展。迄今為止,使用康成生物lncRNA芯片服務的康成客戶發表SCI文章已超過80篇,是國內唯一發表大量SCI論文的商業化lncRNA芯片平臺,其中多篇發表在Cancer Cell、Mol Cell、Hepatology等國際頂尖雜志上。有關康成生物LncRNA最新專題報道:LncRNA: 從分子調控到臨床應用的最新成果

        詳細了解康成生物的circRNA技術服務平臺

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