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          生物通

        生物通首頁 > 今日動態(tài) > 專題總匯 > LncRNA:從分子調(diào)控到臨床應(yīng)用的最新成果2016版


               康成生物工程有限公司(簡稱“康成生物”)自2002年起專注于高通量篩選實驗服務(wù),是國內(nèi)最早一批專業(yè)提供生命科學(xué)前沿研究技術(shù)服務(wù)的高科技企業(yè)。康成生物以lncRNA、microRNA、表觀遺傳學(xué)相關(guān)檢測技術(shù)作為核心研發(fā)方向,是Agilent、Arraystar、Exiqon、SABiosciences等國際知名芯片品牌的服務(wù)代理商。

               2009年,隨著非編碼RNA(ncRNA)研究進展的深入,一類新的ncRNA分子—lncRNA掀起科學(xué)界的熱點話題,并逐漸成為分子生物學(xué)及臨床醫(yī)學(xué)研究的重要方向?党缮锱c美國Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平臺,率先開展lncRNA表達篩查服務(wù)。Arraystar公司是LncRNA研究領(lǐng)域的先驅(qū)和領(lǐng)導(dǎo)者,是lncRNA表達譜檢測的首選平臺。2016年最新推出的第四代LncRNA芯片,來源于最新最全的數(shù)據(jù)庫,并采用嚴格的篩選程序和轉(zhuǎn)錄本特異性設(shè)計,同時檢測LncRNA和mRNA,芯片注釋LncRNA基因組信息、分類及潛在的調(diào)控機制,為深入研究LncRNA復(fù)雜生物學(xué)功能提供參考信息。迄今為止,作為Arraystar中國區(qū)唯一代理商,康成客戶采用Arraystar LncRNA芯片已發(fā)表SCI論文超過160篇,其中多篇發(fā)表在Cancer Cell, Mol Cell,Hepatology等國際頂尖雜志上。

        LncRNA研究背景及其與疾病的關(guān)系




          Arraystar LncRNA芯片:

        LncRNA芯片技術(shù)的領(lǐng)跑者:目前Arraystar發(fā)布了最新版本的人類V4.0 LncRNA芯片和小鼠V3.0 LncRNA芯片。
        經(jīng)典與創(chuàng)新的碰撞:收錄金標準LncRNAs,可靠的LncRNAs以及編碼蛋白的mRNAs,更新、更全面。
        系統(tǒng)而實用的LncRNA注釋:注釋LncRNA基因組信息、分類及潛在的調(diào)控機制,為深入研究lncRNA復(fù)雜生物學(xué)功能提供參考。
        轉(zhuǎn)錄本特異性的探針設(shè)計:芯片探針可以準確地檢測同一基因的不同轉(zhuǎn)錄本。

        Arraystar公司 LncRNA芯片


          LncRNA在臨床醫(yī)學(xué)研究中的新成果:

        LncRNA是臨床醫(yī)學(xué)研究中新興的熱點分子,可以通過不同的分子生物學(xué)機制調(diào)控編碼基因的表達,參與疾病相關(guān)的信號通路,從而對疾病的發(fā)生、發(fā)展及治療有重要作用。作為一類新型的具有生物學(xué)功能的臨床標志物,lncRNA具有非常廣闊的臨床應(yīng)用前景。利用Arraystar公司lncRNA芯片,近年來,國內(nèi)外學(xué)者發(fā)表一系列高水平科研論文,幫助我們進一步認識lncRNA在疾病的重要作用,開拓臨床醫(yī)學(xué)研究的視野,并對我們后續(xù)的科研有進一步的指導(dǎo)意義。


           
          為什么選用LncRNA芯片比RNA-seq更合適:

        LncRNAs比蛋白編碼RNAs表達水平低
        RNA-seq對于低豐度轉(zhuǎn)錄本的定量不準確
        增加測序深度不能提高低豐度轉(zhuǎn)錄本的檢測準確度
        RNA-Seq不能精確定量lncRNA與RNA-Seq數(shù)據(jù)分析不成熟密切
        相關(guān)
        芯片比RNA-Seq更適合低豐度lncRNAs 表達譜的檢測

        Arraystar LncRNA芯片:比RNA-seq更適合于LncRNAs表達譜檢測


          (1)LncRNA與癌癥:

        癌癥相關(guān)的研究是進展最快,成果最豐富的領(lǐng)域。研究者利用Arraystar LncRNA芯片對不同癌癥的發(fā)生、發(fā)展等進行了深入研究。

        Cell最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究乳腺癌的文章
        Cancer Cell最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究肝癌的文章
        Cancer Cell最新發(fā)表:應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究乳腺癌 New!
        J Natl Cancer Inst最新發(fā)表:應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究結(jié)直腸癌 New!
        Gut最新發(fā)表:應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究結(jié)直腸癌 New!
        Hepotology:第二軍醫(yī)大學(xué)與復(fù)旦大學(xué)學(xué)者共同解析癌癥中的lncRNA New!


           
          Arraystar ncRNA Promoter 芯片:

        Arraystar 啟動子芯片是專門為研究啟動子區(qū)域的甲基化,羥甲基化,組蛋白修飾以及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合而設(shè)計的產(chǎn)品,覆蓋所有RefSeq數(shù)據(jù)庫基因的啟動子區(qū)(Arraystar RefSeq Promoter Array)或是所有非編碼RNA的啟動子區(qū)(Arraystar ncRNA Promoter Array),能夠滿足不同客戶的需求。180 K的芯片,啟動子的覆蓋范圍近2kb,并覆蓋了幾乎所有啟動子區(qū)附近的CpG島,是一款高品質(zhì)高性價比的甲基化芯片產(chǎn)品。

        Arraystar Human ncRNA Promoter Microarray
        Arraystar Mouse ncRNA Promoter Microarray


          (2)LncRNA與代謝及心腦血管疾。

        心腦血管疾病以及相關(guān)的代謝疾病是一類嚴重威脅現(xiàn)代人身體健康的疾病。利用細胞、血管、血漿等臨床常見樣本,研究者使用Arraystar LncRNA芯片對這類疾病進行開拓性的研究。

        Circulation Research最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究循環(huán)性生物標記物的文章
        Cell子刊最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究代謝相關(guān)文章
        Diabetologia最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究Ⅰ型糖尿病的文章 New!
        ATVB:應(yīng)用Arraystar lncRNA芯片于動脈粥樣硬化研究 New!


           
          LncPath™ 疾病/信號通路特異性 LncRNA 芯片

        迄今為止,研究得比較透徹的lncRNA還很少,超過99%的lncRNA的功能和調(diào)控機制尚不清楚。為了促進lncRNA的研究,Arraystar公司開發(fā)了LncPath™ 疾病/信號通路特異性LncRNA芯片。LncPath™ 芯片可以同時檢測與特定疾病或信號通路相關(guān)的lncRNA以及相應(yīng)的靶基因,幫助客戶快速的將lncRNA的調(diào)控機制與其在特定的信號通路或疾病中的生物學(xué)功能聯(lián)系起來。

        LncPath™ 疾病/信號通路特異性LncRNA芯片列表 

        疾。

        癌癥
        (HumanMouse)

        心血管疾病
        (HumanMouse)

        神經(jīng)退行性疾病
        (HumanMouse)

         

        信號通路:

        血管生成信號通路
        (HumanMouse)

        細胞凋亡信號通路
        (HumanMouse)

        Wnt 信號通路
        (HumanMouse)

        表觀遺傳信號通路
        (HumanMouse)

        Hedgehog 信號通路
        (HumanMouse)

        Hippo信號通路
        (HumanMouse)

        代謝信號通路
        (HumanMouse)

        凋亡性壞死信號通路
        (HumanMouse)

        上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)信號通路
        (HumanMouse)


          (3)LncRNA與其他疾。

               利用不同疾病的臨床樣本,研究者使用Arraystar LncRNA芯片篩查出疾病特征性lncRNA表達譜變化,提示lncRNA具有廣泛而重要的臨床應(yīng)用價值,為lncRNA的深入研究提供了強有力的臨床依據(jù)。
        Cell子刊最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究宿主抗病毒反應(yīng)的文章
        Arthritis & Rheumatism發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究骨關(guān)節(jié)炎的文章
        Int J Biochem & Cell Biol發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究囊性纖維化的文章


          (4)LncRNA與生殖、發(fā)育、再生:

               LncRNA還廣泛參與生物體的生長發(fā)育、生殖健康、組織再生等基本生物學(xué)過程。針對不同時間點的Arraystar LncRNA芯片結(jié)果,研究者可以深入探討生物生長發(fā)育等過程中的lncRNA表達譜變化,并進一步揭示lncRNA的重要功能。
        BIOLOGY OF REPRODUCTION發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究雄性生殖文章
        Plos One發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究先兆子癇的文章
        Hepatology最新發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片研究肝再生的文章
          (5)LncRNA與藥物:

               藥物相關(guān)的lncRNA研究是一類極為重要、具有重大應(yīng)用價值的研究方向。利用Arraystar LncRNA芯片,研究者可以對藥物的藥理、毒理、成癮性、安全評估等方面進行系統(tǒng)而全面的分析,為人類的健康提供可靠保證。
        川大生物治療國家實驗室應(yīng)用LncRNA芯片解析可卡因成癮機制
        Biochemical Pharmacology發(fā)表應(yīng)用Arraystar LncRNA芯片揭示TSA抗癌機制






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